单核苷酸多态性在疾病相关性分析中的编码问题研究

发布时间：2017-09-04 14:13

  本文关键词：单核苷酸多态性在疾病相关性分析中的编码问题研究

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【摘要】：作为第三代遗传标记的单核苷酸多态性(SNP)具有数量众多、分布广泛且遗传稳定性等特点,其是疾病-基因相关性以及药物设计等研究的基础所在。这类研究多采用基于计算的方法,因此如何对SNP进行适当的编码进而提升算法的性能是其中十分关键的一个环节,然而目前专门针对SNP编码问题的研究还相对较少。在常用SNP表示方式的基础上,根据疾病易感性研究的特点,并结合SNP之间的关联性,提出了几种新的编码方法。大量实验表明,编码方式对疾病易感性分析算法的性能有着较大的影响,基于分布信息的编码方法能获得更好的结果,即其能更好地对SNP序列进行描述,在最大程度上保留原有生物序列所携带的丰富信息,更适合于疾病易感性研究。
【作者单位】： 西京学院控制工程学院;武警工程大学电子技术系;
【关键词】： 单核苷酸多态性 编码 疾病易感性
【基金】：陕西省教育厅科研计划项目(15JK2187) 西京学院科研基金项目(XJ140115) 武警工程大学基础研究基金项目(WJY201518)资助
【分类号】：R394;Q811.4
【正文快照】： 本文受陕西省教育厅科研计划项目(15JK2187),西京学院科研基金项目(XJ140115),武警工程大学基础研究基金项目(WJY201518)资助。1引言快速发展的基因分型技术使得研究疾病与基因之间的相关关系成为可能,单核苷酸多态性(Single Nucleotide Poly-morphism,SNP)由于具有高密度以及

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本文编号：791990