副溶血弧菌分子分型数据库建立与分析

发布时间：2017-09-29 23:06

  本文关键词：副溶血弧菌分子分型数据库建立与分析

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【摘要】：目的对我国8个省(直辖市)分离的副溶血弧菌使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)开展分子分型工作进行回顾性分析;建立副溶血弧菌PFGE分型数据库,分析其特征。方法对2005 2014年期间分离自8个省(直辖市)的617株副溶血弧菌使用SfiⅠ酶切后进行PFGE实验,使用Bio Numerics 5.01软件分析菌株的PFGE图谱并建立副溶血弧菌分子分型数据库。结果本研究所建立的副溶血弧菌分子分型数据库共包含617条副溶血弧菌的分子分型信息。这些副溶血弧菌的PFGE图谱可以分为360个PFGE型别,按照Pulse Net China的规则对这些PFGE型别进行编码。不同PFGE型别的相似系数介于35.8%~99.6%。237株外环境和食品分离菌株有221个PFGE型别,345株患者分离株有127个PFGE型别。相同血清型的副溶血弧菌具有相同或者非常相似的PFGE型别,而不同血清型之间的副溶血弧菌的PFGE型别差异则较大。大流行血清型(如O3∶K6和O4∶K8)具有多个优势PFGE型别,对于某些血清型,地理位置相近省份分离菌株的PFGE图谱相似性更高。结论分离自患者菌株的PFGE图谱克隆化程度高,而分离自食品和外环境的菌株,PFGE图谱多态性较大。PFGE在发现病例成簇中能够发挥作用;对于患者相关PFGE图谱成簇的菌株应加强流行病学调查和溯源工作。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【关键词】： 副溶血弧菌 脉冲场凝胶电泳 分子分型数据库 多样性 暴发调查
【基金】：国家科技重大专项(No.2012ZX10004215)~~
【分类号】：R378.3
【正文快照】： 作者单位:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京102206Corresponding author:PANG Bo,Email:pangbo@icdc.cn新技术的发展使得病原体研究实验室能够有更多的手段对病原体进行不同层次的分析,以揭示不同病原体之间的关系,从而为传染病暴发的鉴定和追踪提供可靠的可供参考

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5 孙作O，

本文编号：944725