高通量测序筛选结核分枝杆菌耐药株差异基因

发布时间：2017-10-10 04:30

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【摘要】：目的比较结核分枝杆菌中敏感株、多耐药株、广泛耐药株三者间基因表达的差异,为进一步针对耐药菌株的研究提供方向。方法从深圳市第三人民医院收集敏感株、多耐药株、广泛耐药株各1株,提取菌株RNA,然后构建cDNA文库,使用Genome Analyzer IIx高通量测序仪进行全基因组测序,经过筛选比对后得到测序结果 ,再比较3个菌株间的基因表达差异。结果高通量测序后共得到基因3 968个。将耐药株与敏感株的基因进行比较,选取表达差异高于10倍的基因,筛选得到多耐药株差异基因16个、广泛耐药株差异基因10个。这些表达差异基因大部分与毒素-抗毒素系统、PE/PPE家族蛋白、金属转运蛋白相关。还在多耐药株中发现了一系列高表达的前噬菌体基因及噬菌体整合相关的基因。结论通过高通量测序筛选得到一系列耐药株差异表达基因,为未来对耐药菌株的研究提供依据。
【作者单位】： 中山大学中山医学院微生物学教研室;中山大学热带病防治研究教育部重点实验室;广东医学院附属深圳市第三人民医院肝病研究所;暨南大学第二临床医学院深圳市人民医院胸外科;
【关键词】： 结核分枝杆菌 耐药株 高通量测序
【基金】：国家自然科学基金(C080102) 国家自然科学基金委员会与美国国立卫生研究院合作研究项目(812111408)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是世界上严重危害人类的病原体之一。结核病至20世纪70年代一度得到抑制,发病率不断下降,其后由于耐药菌株的出现,以及艾滋合并结核病人的增多,结核病再度死灰复燃[1]。据卫生部2007-2008年的统计数据显示,我国每年新发耐多药肺结核

【参考文献】

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1 陈建波;刘映霞;罗燕芬;李劭源;刘厚明;单万水;邓群益;陆坚;曹开源;曾谷城;;深圳地区结核临床分离菌基因突变与耐药的关系[J];热带医学杂志;2013年08期

2 熊鸣;李明;郑丹阳;黄伟;;毒素-抗毒素系统在应激环境下的生物学作用的研究进展[J];现代生物医学进展;2013年01期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 吴为群,吴忠道,张扣兴,谢灿茂,容中生;结核分支杆菌异烟肼耐药的分子机制及其快速鉴定[J];热带医学杂志;2003年03期

2 李芳芳,方红辉,何林,吴伟元,廖生峗,张舒林;结核分枝杆菌耐药基因rpoB.katG.inhA突变快速检测方法研究[J];热带医学杂志;2005年06期

3 刘良安;李秋梅;张志军;;PCR-SSCP检测耐多药结核菌基因与细菌培养结果对比分析[J];热带医学杂志;2006年07期

【相似文献】

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1 李珏;鲍作义;刘思扬;庄道民;李韩平;刘永健;李林;杨坤;李敬云;;HIV-1拉米夫定(3TC)耐药毒株的体外诱导培育和鉴定[J];中华微生物学和免疫学杂志;2006年03期

2 石宇雄;黄永明;张娴;危建安;徐逸生;许少健;黎重菊;贾晗;;骨肉瘤体外多药耐药模型R-KHOS的建立及其意义[J];广东医学;2009年05期

3 何树梅;张敏;贺拥军;丁静;袁尔亚;;结核分枝杆菌异烟肼耐药与KatG基因相关性[J];中国公共卫生;2010年08期

4 黄穗;人巨细胞病毒的耐药性研究进展[J];国外医学.病毒学分册;2001年03期

5 刘永芳;吕晓菊;;铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素的耐药性[J];中国抗生素杂志;2005年11期

6 孙海平;林宁;;多重耐药大肠埃希菌复方新诺明耐药相关基因研究[J];现代检验医学杂志;2008年05期

7 王应斌,王宏,刘俐,詹青松;粘附式细胞仪测试热带念珠菌耐药株DNA荧光强度的研究[J];岭南皮肤性病科杂志;1998年03期

8 汤武亨;曹春宇;金海;李松财;陈国光;;海岛地区就医患者幽门螺杆菌对常用抗生素的耐药特点分析[J];临床内科杂志;2008年04期

9 姜英;彭俊平;杨帆;余黎;王玉琳;金奇;;结核分枝杆菌耐吡嗪酰胺分子机制研究[J];微生物学免疫学进展;2007年01期

10 李召东;陈瑜;王明法;胡旭;李凫坚;严杰;程建玲;;结核杆菌耐药的分子机制研究[J];中国医药导报;2007年02期

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1 黄海蓉;马s，

本文编号：1004362