中国广西登革3型病毒分离株基因组序列特征分析

发布时间：2017-10-16 08:32

  本文关键词：中国广西登革3型病毒分离株基因组序列特征分析

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【摘要】：目的对我国广西登革3型病毒分离株桂登-1株(GD-1株)和桂登-11株(GD-11株)进行全基因组序列测定和分析,为了解其地理来源提供依据。方法根据GenBank提交的登革3型病毒基因序列设计9对引物,RT-PCR方法分段扩增GD-1和GD-11株基因序列,测序后进行拼接,得到其全基因组序列。结果两株病毒全长均为10 707nt,与国际参考株H87株核苷酸同源性为96.0%,氨基酸同源性为98.8%。GD-1株和GD-11株间仅有4个氨基酸差异,二者与H87株分别存在39和41个氨基酸差异。对3'UTR二级结构进行预测,二者与H87株存在较大差异。根据E蛋白基因序列对两株病毒进行进化分析,GD-1和GD-11均属于亚型Ⅱ,与分离自泰国的两毒株进化关系较近。结论 GD-1和GD-11均属于登革3型病毒亚型Ⅱ,二者可能是源自泰国的病原。
【作者单位】： 中国食品药品检定研究院;
【关键词】： 登革型病毒 亚型 二级结构 进化树
【分类号】：R373
【正文快照】： 登革病毒(Dengue virus)属黄病毒科(Flaviviridae)黄病毒属(Flavivirus),根据其抗原性分为DEN-1、DEN-2、DEN-3和DEN-4等4个血清型。登革病毒可引起登革出血热(dengue hemorrhagic fever,DHF)和登革热休克综合征(dengue shock syndrome,DSS)。目前普遍认为DEN-1、DEN-2、DEN-3

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本文编号：1041710