大理地区结核分枝杆菌MIRU-VNTR位点的多态性分析

发布时间：2017-10-16 18:30

  本文关键词：大理地区结核分枝杆菌MIRU-VNTR位点的多态性分析

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【摘要】：目的了解大理地区结核分枝杆菌基因组中的数目可变串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)即MIRU(mycobacterium interspersed repetitive unit)基因多态性,探讨MIRU-VNTR位点多态性的应用价值。方法采用PCR和琼脂糖凝胶电泳检测大理地区临床分离的60株结核分枝杆菌7个VNTR位点,采用MIRU-VNTR技术进行分型,利用Hunter-Gaston指数(HGI)对各MIRU进行分辨力评价,并应用Quantity one软件和BioNumerics6.6软件进行数字化和聚类分析。结果 60株结核分枝杆菌分为5个基因群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ群)52个基因型。Ⅰ群占56.77%,含有29个基因型;Ⅱ群占25.00%,含有13个基因型;Ⅲ群占8.33%,含有5个基因型;Ⅳ群占6.67%,含有3个基因型;Ⅴ群占3.33%,含有2个基因型。7位点组合总分辨力为0.900,最高ETR-E位点0.735,最低ETR-C位点0.455。结论大理地区分离株结核分枝杆菌存在基因多态性,7位点MIRU-VNTR分型简便快速,分辨力高,适合用于大理地区结核分枝杆菌的基因分型检测。
【作者单位】： 大理学院基础医学院微生物学与免疫学教研室;
【关键词】： 结核分枝杆菌 基因分型 多位点可变串联重复序列 多态性 Hunter-Gaston指数
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81260456)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： ***结核病是全球流行的传染病之一,是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性传染病,可累及全身各器官。我国是22个结核病高负担国家之一[1],追踪传染源,研究传播情况是防止我国结核病流行的重要内容。MTB基因组中的可变串联重复序列(VNTR)即MIRU(mycobact

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【相似文献】

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本文编号：1044264