miRDOA:集数据存储与在线分析于一体的综合型microRNA数据库

发布时间：2017-10-25 04:07

  本文关键词：miRDOA:集数据存储与在线分析于一体的综合型microRNA数据库

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【摘要】：miRNA(microRNA)是一类小的非编码RNA,普遍存在于动物、植物等多个物种中,研究表明在原生生物以及病毒中也有miRNA。miRNA在生物的成长、发育、细胞凋亡、神经紊乱、癌症等多个方面都起到至关重要的作用,miRNA还可作为Biomarker应用于癌症等疾病的诊断和治疗。miRDOA(miRNA Database and Online Analysis)数据库存储了二百多个物种的miRNA相关信息,提供了基本的浏览和搜索功能。用户可以通过物种来浏览miRNA相关数据,也可以通过miRNA、靶基因或者序列进行检索。除此之外,miRDOA还提供了在线分析模块,主要对高通量测序数据进行初步分析,在此基础上,添加了靶基因预测、表达谱数据差异分析,以及在线BLAST功能。miRDOA是一个完全免费的开源的数据库网站,并实时更新。
【作者单位】： 北京市计算中心;
【关键词】： miRNA 高通量测序 靶基因 在线分析
【基金】：北京市科学研究院萌芽项目
【分类号】：TP311.13;R3416
【正文快照】： miRNA是一类非编码的短RNA,长度~22nt,以单链的形式存在于细胞中,通过对靶基因的调控来实现生物学功能[1-2]。miRNA最初在细胞内反转录成pri-miRNA,之后通过一系列的加工生成pre-miRNA,再经过复杂加工生成成熟的miRNA[3]。miRNA主要通过与靶基因的互补配对来调控基因表达,主要

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本文编号：1091982