蛋白质折叠计算机模拟研究进展

发布时间：2017-10-28 12:00

  本文关键词：蛋白质折叠计算机模拟研究进展

  更多相关文章： 蛋白质折叠 并行蒙特卡洛算法 蛋白质结构预测 分子动力学模拟 蛋白质折叠病

【摘要】：蛋白质折叠过程中的结构变异可能导致"折叠病",比如老年痴呆症和多聚谷氨酰胺疾病等。因此蛋白质折叠研究对于揭示"折叠病"致病机理、指导药物设计等具有重大意义。文章阐述了蛋白质折叠计算机模拟研究的研究近况,分别介绍了蛋白质侧链研究、蛋白质折叠算法、蛋白质折叠病研究、蛋白质的分子动力学模拟和蛋白质结构预测等几个方面。
【作者单位】： 中国科学院深圳先进技术研究院高性能计算技术研究中心深圳市高性能数据挖掘重点实验室;
【关键词】： 蛋白质折叠 并行蒙特卡洛算法 蛋白质结构预测 分子动力学模拟 蛋白质折叠病
【基金】：国家自然科学基金项目(11204342) 深圳市科创委项(JCYJ20120615140912201) 深圳市孔雀计划项目(KQCX20130628112914299)
【分类号】：R3411
【正文快照】： 1引言蛋白质折叠问题是研究蛋白质如何在短时间内从一级结构(一维多肽链)折叠为天然三维结构,形成具有生命功能的大分子。生物体的遗传信息(DNA)通过RNA转录和翻译过程传递给蛋白质,因此蛋白质折叠也被称为第二遗传密码,相关研究可以帮助揭示生命遗传信息的表达和功能传递的奥

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 范东辉;;严重影响健康的老年痴呆症[J];中国检验检疫;2006年12期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 宁宇;李波;方芳;田丽君;王雪;高远;刘娅;;人口老龄化与老年人口健康及疾病问题的研究进展[J];吉林大学学报(医学版);2008年06期

2 赵仕凤;;老年痴呆的预防保健[J];当代护士(专科版);2009年02期

3 史晓玲;袁德培;;从“毒”探讨老年性痴呆的病因病机[J];湖北民族学院学报(医学版);2011年03期

4 杨力权;桑鹏;李珍贵;;捕食线虫真菌丝氨酸蛋白酶PII结构的同源模建[J];大理学院学报;2013年10期

5 周晓峰;谢小露;张蕾;李春华;楼姣英;刘乃波;丁振山;;基于弹性网络模型的麦芽糖转运蛋白功能残基的识别[J];高等学校化学学报;2014年06期

6 程正华;张贵军;邓勇跃;金媚媚;;一种新的蛋白质结构预测多模态优化算法[J];计算机科学;2013年09期

7 韩榕生;吴国庆;张美玲;;一种有效扩大蛋白质同源建模尺度方法[J];河北科技师范学院学报;2013年03期

8 LI YanChun;WANG YongLei;LI ZhanWei;LIU Hong;Lü ZhongYuan;;Towards larger spatiotemporal scales in polymer simulations[J];Chinese Science Bulletin;2013年30期

9 彭丰斌;张慧玲;魏彦杰;冯圣中;殷志祥;;基于并行群体模拟退火算法的蛋白质折叠研究[J];科研信息化技术与应用;2013年05期

10 张慧;尚少梅;;老年痴呆病人生活质量的研究现状[J];护理研究;2008年19期

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 袁林;固本健脑法对MCI大鼠学习记忆能力及海马Caveolin-1的影响[D];湖北中医药大学;2011年

2 黄琼;解毒补肾法对老年性痴呆模型大鼠抗炎作用的实验研究[D];湖北中医药大学;2010年

3 李游山;家蚕蛋白酶抑制剂抵御昆虫致病性真菌入侵的分子机理研究[D];西南大学;2013年

4 万小波;蛋白激酶小分子抑制剂选择性及其JAK2激酶调控机制的计算化学研究[D];北京协和医学院;2013年

5 侯涛;二甲双胍对肺腺癌细胞系PC9、PC9/GR增殖抑制、凋亡诱导及吉非替尼增敏作用的研究[D];中南大学;2013年

6 王佳新;蛋白质结构域预测及唾液分泌蛋白质预测与应用研究[D];吉林大学;2013年

7 田兴玲;不同种类的小分子在碳纳米管内“竞争性吸附”的分子动力学研究[D];浙江大学;2013年

8 王会征;一种与聚羟基脂肪酸酯生物合成相关的新型水合酶结构生物学研究[D];山东农业大学;2013年

9 乔智威;流体混合物吸附分离的分子模拟研究[D];华南理工大学;2013年

10 张鲁嘉;基于结构认知和理论计算的LipK107等酶的机制研究和设计改造[D];华东理工大学;2014年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 陈伟然;电针对脑缺血再灌注损伤小鼠凋亡蛋白Fas、Bcl-xL、P53的表达研究[D];河北医科大学;2009年

2 刘蒙蒙;结合虚拟筛选、分子动力学以及MM-PBSA方法对昆虫β-N-乙酰己糖胺酶的新型潜在抑制剂的研究[D];西北大学;2013年

3 陆小亮;蛋白质折叠理论研究[D];华东师范大学;2013年

4 周芳;富血小板纤维蛋白对体外培养牙周膜细胞及成骨细胞的影响[D];辽宁医学院;2013年

5 金媚媚;分子构象多模态优化算法设计及实现[D];浙江工业大学;2013年

6 王艳杰;非编码RNA三级结构评估与扭转角统计分布研究[D];华中科技大学;2013年

7 郭莉;不同电场强度下Au取代二元胺DAPDI结构和性质的理论研究[D];山西师范大学;2014年

8 翟红秀;5-（2-呋喃基或噻吩基）-4-硫-（2’-脱氧）尿苷合成及生物活性的研究[D];大连大学;2014年

9 韩毛振;维吉尼亚链霉菌IBL14中氧甲基转移酶基因的鉴定和功能分析[D];安徽大学;2014年

10 张妮佳;基于分子构象设计构建高活性细胞因子白介素IL-21[D];华中师范大学;2014年

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 陈德权;蛋白质折叠与装配研究新进展[J];国外医学.分子生物学分册;1995年04期

2 巴德年;医学科学的六个新课题[J];发明与革新;2002年12期

3 孙强玲;刘银坤;;内质网甘露糖甙酶-Ⅰ样蛋白的研究进展[J];国际检验医学杂志;2006年09期

4 唐兵;蛋白质的折叠[J];氨基酸和生物资源;1997年03期

5 刘国庆;张正祥;符兆英;;蛋白质折叠的基本原理与分子伴侣[J];延安大学学报(医学科学版);2008年02期

6 陆荫英,成军,张玲霞;分子伴侣及其与乙型肝炎病毒的关系[J];胃肠病学和肝病学杂志;2002年02期

7 陈彦涛,罗钟琳,丁建东;SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究[J];高等学校化学学报;2003年08期

8 ;蛋白质[J];国外科技资料目录(医药卫生);1998年07期

9 巴德年;;医学科学的六个新课题[J];科学咨询(科技信息);2002年04期

10 胡红雨，杜雨苍，，鲁子贤;二级结构形成：蛋白质折叠起始过程的框架模型[J];生物化学与生物物理进展;1994年06期

中国重要会议论文全文数据库 前7条

1 王志珍;;蛋白质折叠异常或蛋白质折叠错误-蛋白质聚集-构象病[A];中国科协2005年学术年会生物物理与重大疾病分会论文摘要集[C];2005年

2 王爱娥;张睢扬;董书魁;梅开城;马建新;王东霞;王英;;氯霉素抗性融合蛋白报告系统的建立与验证[A];第十届全军检验医学学术会议论文汇编[C];2005年

3 张蕾;李雁洁;欧阳浩淼;周慧;金城;;蛋白质N-糖基化加工对烟曲霉(Aspergillus fumigatus)极性生长的影响[A];2008年全国糖生物学学术会议论文摘要[C];2008年

4 冯银刚;刘东升;王金凤;;应用异核多维核磁共振方法研究金黄色葡萄球菌核酸酶片段的整体构象不均一性[A];第十二届全国波谱学学术会议论文摘要集[C];2002年

5 周筠梅;;蛋白质的错误折叠与疾病[A];西部大开发 科教先行与可持续发展——中国科协2000年学术年会文集[C];2000年

6 方慧生;蒋华良;陈凯先;;蛋白质天然构象预测研究进展[A];The 2nd Cross-Straits Symposium on Biology-Inspired Theoretical Problems--Proceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop[C];2000年

7 毛启龙;昌增益;;结核杆菌小分子热休克蛋白Hsp16.3的分子伴侣作用机制[A];中国生物化学与分子生物学会第八届会员代表大会暨全国学术会议论文摘要集[C];2001年

中国重要报纸全文数据库 前1条

1 余志平;蛋白质折叠错误 药物研究遇难题[N];中国医药报;2003年

中国博士学位论文全文数据库 前3条

1 徐菲菲;钙网蛋白介导的内质网应激相关凋亡参与心肌细胞缺氧/复氧损伤[D];中国人民解放军军医进修学院;2009年

2 张绍武;基于支持向量机的蛋白质分类研究[D];西北工业大学;2004年

3 张e

本文编号：1108102