对基因组内不同序列分布差异进行量化的探讨

发布时间：2017-11-08 05:37

  本文关键词：对基因组内不同序列分布差异进行量化的探讨

  更多相关文章： 基因组序列 分布差异 Kolmogorov-Smirnov检验 图心 数值模拟

【摘要】：目的针对DNA词频分析中序列分布问题,探讨对基因组内不同序列的分布差异进行量化的可行性。方法该研究采用数值模拟的方法对Kolmogorov-Smirnov检验的统计量和累积概率曲线下图形的图心进行了比较。结果随着样本含量的增加,两个指标的离散趋势逐渐减小,但其集中趋势并没有受到明显影响,且不同的分布集中于不同的位置;当样本含量为100时,所能判别的最小统计量差异约为0.1,图心差异约为0.02;使用统计量指标时,需采用两个基准分布才能将5个待测分布分开,而图心指标可以直接将5个待测分布分开。结论两个指标都可以看作分布差异的量化指标,但在大多数情况下样本含量应该大于100;当需要在同一坐标系表示不同分布时,图心可能是一个较好的选择。
【作者单位】： 山西医科大学公共卫生学院医学统计学教研室;美国密西根州立大学统计与概率系;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31071156)
【分类号】：R3416
【正文快照】： 基因组常被比喻为一本“生命天书”,如果有几个关键词在书中出现的位置比较接近,则其关系可能比较密切。反之,若其出现的位置具有明显差异,则其可能关系较远。如果把序列看作是基因组内的关键词,则序列在基因组上出现的位置差异则可能说明这些序列之间的功能差异。如果两个重

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本文编号：1155833