双歧杆菌Ⅱ型毒素-抗毒素系统-MazEF的分子进化分析

发布时间：2017-11-18 14:18

  本文关键词：双歧杆菌Ⅱ型毒素-抗毒素系统-MazEF的分子进化分析

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【摘要】：目的:对双歧杆菌属编码的Ⅱ类毒素-抗毒素(TA)系统MazEF进行分子进化分析。方法:利用PSI-BLAST在NCBI中搜索获得双歧杆菌编码的MazF分子序列,在NCBI蛋白数据库、核酸数据库分别下载其他菌属基因组编码的MazF蛋白序列和本研究所涉及菌属的16 S rRNA序列,应用Clustal X2和MEGA4软件对Maz F做分子进化分析。结果:共搜索到双歧杆菌株染色体编码毒素蛋白MazF 26个。分子进化分析显示:整个双歧杆菌属的MazF保守性不好;MazF与16 S rRNA的共进化仅在个别菌种中发现,大部分MazF的聚类结果与相应菌种16 S rRNA的聚类结果不同。结论:双歧杆菌中的TA系统MazEF可能是通过基因的水平转移整合入基因组中,属于菌株非核心基因组部分。
【作者单位】： 徐州医学院基础医学院;徐州医学院口腔医学院;
【基金】：国家自然科学基金(31300029) 江苏省自然科学基金(BK20130213) 江苏省高校自然科学基金项目(12KJB320015)
【分类号】：R378
【正文快照】： The Molecular Evolution of TypeⅡToxin-antitoxin(TA)System-Maz EF in Bifidobacterial Genomes/WEI Yan-xia,LIU Dian-bin,ZHENG Ji-wei,et al.//Medical Innovation of China,2014,11(34):016-019Ⅱ类毒素-抗毒素(TA)系统,最早在1982年于大肠埃希菌的低拷贝质粒中发现。

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本文编号：1200079