沙眼衣原体基因分型及omp1基因多态性研究

发布时间：2017-12-27 19:41

  本文关键词：沙眼衣原体基因分型及omp1基因多态性研究　出处：《南华大学》2005年硕士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】：目的 研究从中国部分城市分离的沙眼衣原体临床株的基因型,通过测序及进化树分析Omp1基因的多态性,掌握中国Ct感染的流行病学特征,为Ct疫苗的研制及Ct感染的防治提供实验依据。 方法 从不同城市收集可疑的临床标本,用McCOY细胞培养,Ct阳性标本用于研究。按文献设计特异性引物,巢式PCR扩增MOMP约980bp的基因片段(包括四个变异区),用内切酶Alu Ⅰ、Msp Ⅰ、EcoR Ⅰ、Dde Ⅰ酶切相应PCR产物,用3%琼脂糖凝胶及18%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离。同时从GENEBANK中获得Ct各参考株的Omp1基因序列,用DNA star软件分析目的片段的酶切位点,得到各参考株上述四种内切酶的酶切图谱。根据各参考株与临床株的酶切图谱,将临床株分型。随机选择部分临床株PCR产物双向测序,用Mega3软件构建进化树分析临床株与各参考株之间的亲缘关系。 结果 细胞培养301份阳性标本,PCR扩增出286份,其中湖南衡阳48例、上海32例、广州52例、广东江门154例。RFLP分型检测,共检出10个基因型,分别为E(30.8%)、J(23.8%)、D(17.5%)、F(10.5%)、G(6.2%)、H(3.5%)、K(2.8%)、Ba(2.1%)、Da(1.4%)和I(1.4%)型,并且不同城市间基因型的分布没有明显区别(P0.05)。 对其中86份标本测序,BLAST及进化树分析发现,测序分型结果与RFLP结果完全吻合,且发现28种基因变体,其中E、F型Omp1基因高度保守,而其它基
[Abstract]:Objective to study the genotype of clinical isolates of Chlamydia trachomatis isolated from some cities in China, analyze the polymorphism of Omp1 gene by sequencing and phylogenetic tree, and grasp the epidemiological characteristics of Ct infection in China, so as to provide experimental evidence for the development of Ct vaccine and the prevention and treatment of Ct infection.
【学位授予单位】：南华大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2005
【分类号】：R374

【参考文献】

相关期刊论文 前2条

1 李珊山,叶顺章;南京地区性病患者沙眼衣原体感染的基因分型[J];中国皮肤性病学杂志;1999年02期

2 余加林,吴仕孝,刘官信;裂解酶片段长度多态性对沙眼衣原体的初步分型[J];中华医学检验杂志;1998年04期

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本文编号：1342959