耶尔森氏菌91001株基因组测序、比较基因组学及Ⅲ型分泌系统研究

发布时间：2018-01-01 04:29

  本文关键词：耶尔森氏菌91001株基因组测序、比较基因组学及Ⅲ型分泌系统研究　出处：《中国人民解放军军事医学科学院》2005年博士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】：鼠疫耶尔森氏菌是烈性传染病鼠疫的病原体,曾在世界上引起过三次大流行,造成至少一亿六千万人的死亡。近年,随着鼠疫作为生物恐怖战剂的活动有所增加,鼠疫病例的上升,多重耐药菌的出现及致病机制仍不十分明确,因此,进行鼠疫的致病研究非常重要。为了进一步探索鼠疫致病的分子机制,我们进行鼠疫耶尔森氏菌91001株基因组测序、强致病性与弱致病性株间的比较基因组学分析,比较已知毒力岛及毒力基因的变化,鉴定可能的新毒力因子,并进一步分析了鼠疫耶尔森氏菌等革兰氏阴性菌中广泛存在的毒力岛——Ⅲ型分泌系统的序列及结构特征,深入探索了基于模体保守和结构保守的可能的分子伴侣分泌信号机制。 鼠疫耶尔森氏菌91001株的全基因组序列测定及注释 通过鸟枪法测定对人无致病性,而对小白鼠表现强毒的91001株全基因组序列,并与完成测序的对人具有强致病性的CO92株和KIM株进行对比研究,从基因组水平了解鼠疫耶尔森氏菌对人致病机制的序列基础,寻找新的毒力基因,进一步揭开鼠疫对人体致病的分子基础。通过鸟枪法测序获得一条染色体序列及四个质粒pPCP1、pMT1、pCD1和pCRY序列,分别长约4,595,065bp,9,609bp,106,642bp,70,159bp,21,742bp,其中质粒pMT1、pCD1和pPCP1的序列与参考株CO92和KIM株基本一致,质粒pCRY为新发现的、未见报道的质粒,具有独立复制能力,编码Ⅳ型分泌系统基因。染色体基因组上共编码4,037个CDS,其中信号转导机制有关基因100个,细胞运动和分泌基因204个,DNA复制、重组和修复基因296个,转录、调控基因205个,假基因141个。pCD1质粒上共预测基因98个,主要编码Ⅲ型分泌系统基因簇,pMT1质粒上共预测基因129个,大部分是假定蛋白。通过蛋白质组学分析,鉴定了1193个蛋白,占基因组预测CDS的28.7%,完全对应于染色体上的预测基因。 鼠疫耶尔森氏菌比较基因组学研究 通过生物信息学方法比较鼠疫耶尔森氏菌CO92、KIM和91001株的基因组发
[Abstract]:Yersinia pestis is the pathogen of plague, which has caused three pandemics in the world and killed at least 160 million people in recent years. With the increase of plague as a bioterrorist warfare agent and the increase of plague cases, the emergence and pathogenesis of multidrug resistant bacteria are not very clear. It is very important to study the pathogenesis of plague. In order to further explore the molecular mechanism of plague, we sequenced the genome of 91001 strains of Yersinia pestis. Comparative genomics analysis between strong pathogenicity and weak pathogenicity plants compared known virulence islands and virulence genes and identified possible new virulence factors. Furthermore, the sequence and structural characteristics of virulence island type 鈪，

本文编号：1362926