当前位置:主页 > 医学论文 > 病理论文 >

血清饥饿条件下microRNA表达谱的变化及其功能研究

发布时间:2018-02-23 13:38

  本文关键词: 微小RNA 靶基因 细胞凋亡 基因表达 出处:《天津医科大学》2007年硕士论文 论文类型:学位论文


【摘要】:目的: MicroRNA (miRNA)是一类新发现的能够调控其靶基因表达水平的小RNA分子。近几年已经发现并确定了上千种miRNA,目前1miRNA的功能研究正日益成为生物学一个非常活跃的研究领域。本研究旨在结合生物信息学、基因芯片技术检测血清饥饿状态下参与调控的miRNA并预测其靶基因,对血清饥饿状态下参与调控的miRNA对细胞活性的影响进行初步研究。 方法: 利用miRNA芯片技术对血清饥饿培养条件下(不含血清的培养基)和正常培养条件下(含10%血清的培养基)人类正常肝细胞系L02中miRNA的表达水平进行比较。对在血清饥饿条件下表达增高的miRNA(miR-27a、miR-320、 miR-338)使用miRNA反义寡聚核苷酸序列特异性抑制细胞内:niRNA (miR-27a、miR-320、miR-338)功能;对在血清饥饿条件下表达降低的miRNA (miR-181b1)使用小干扰RNA特异性增强细胞内miRNA (miR-181b1)功能;然后利用MTT法分析miRNA对细胞活性的影响。然后进行TUNEL法测定它们分别对细胞凋亡的影响。在此基础上结合靶基因预测程序和mRNA表达谱芯片的结果对miRNA的靶基因进行预测和筛选。 结果: 通过对miRNA表达谱基因芯片结果的分析发现在血清饥饿状态下人类正常肝细胞系L02中miR-27a、miR-320、miR-338的表达升高,miR-181b1的表达下降。随后利用MTT法和TUNEL法实验对miR-27a、miR-320、miR-338、 miR-181bl的功能进行筛选分析,发现在L02细胞中miR-27a、miR-320、miR-338功能受到抑制后细胞的活性均明显受到抑制,miR-181b1功能增强后细胞的活性明显被增强。 在此基础上利用长寡聚核苷酸基因芯片(共7267个人类基因,包含凋亡相关基因、肿瘤相关基因、信号转导相关基因、肝酶代谢相关基因、细胞因子相关基因)分析血清饥饿状态下mRNA表达谱的变化,选取表达有差异基因,经基因芯片结果分析与靶基因预测程序相比较初步预测:adcy3、bc13、h1x1等是hsa-miR-27a的靶基因,ctnnb1、ywhaq、adcy3等是hsa-miR-320的靶基因,tps19、p4hb、atp5gl等是hsa-miR-338的靶基因,bcl-9、ddit4、dusp10等是hsa-miR-181b-1的靶基因。 结论: 本文首次确定了血清饥饿状态下参与调控的miRNA,并初步确定了miR-27a、miR-320、miR-338和miR-181b1在人类细胞内的靶基因。miR-27a、 miR-320、miR-338和miR-181b1可以分别介导其各自的靶mRNA的降解,调控血清饥饿状态下细胞的应答反应。这有助于我们深化对于细胞的生长和凋亡等生物学特性及其调控机制的理解。
[Abstract]:Objective:. MicroRNA simiRNAs are a new class of small RNA molecules which can regulate the expression level of their target genes. In recent years, thousands of miRNAs have been discovered and identified. At present, the functional study of 1miRNAs is becoming a very active research field in biology. The purpose of this study is to combine bioinformatics, The miRNA involved in the regulation of serum starvation was detected by gene chip technique and its target gene was predicted. The effect of miRNA on cell activity was studied preliminarily. Methods:. MiRNA microarray technique was used to compare the expression of miRNA in human normal liver cell line L02 under the condition of serum starvation (medium without serum) and normal culture (medium containing 10% serum). MiRNA antisense oligonucleotide sequence was used to specifically inhibit the function of miRNA antisense oligodeoxynucleotides (miRNA antisense oligodeoxynucleotides). Low expression of miRNA miR-181b1) was used to enhance intracellular miRNA miR-181b1 function with small interfering RNA. Then the effect of miRNA on cell activity was analyzed by MTT method, and then the effect of miRNA on cell apoptosis was determined by TUNEL method. Based on this, the target genes of miRNA were predicted and screened by combining the results of target gene prediction program and mRNA expression microarray. Results:. The results of miRNA gene chip analysis showed that the expression of miR-27a1 miR-320mmiR-338 increased in human normal liver cell line L02 under the condition of serum starvation, and the expression of miR-181b1 was decreased. Then the function of miR-27aF- 320miR-338, miR-181bl was screened by MTT and TUNEL assay. It was found that in L02 cells, the activity of miR-27aanfmiR-320miR-338 was obviously inhibited after the function of miR-181b1 was enhanced. Using oligonucleotide microarray (7267 human genes, including apoptosis-related genes, tumor-related genes, signal transduction related genes, liver enzyme metabolism-related genes, etc. Cytokine related genes (cytokine related genes) were used to analyze the changes of mRNA expression profile under the condition of serum starvation, and the differentially expressed genes were selected. The results of microarray analysis were compared with the program of target gene prediction. It was preliminarily predicted that the target gene of hsa-miR-27a is the target gene of hsa-miR-27a, ttnnb1, ywhaqadcy3 and so on. It is the target gene of hsa-miR-320, tps19, p4hbnatp5gl, etc. It is the target gene of hsa-miR-338, bcl-9DDIT4dusp10 and so on, which is the target gene of hsa-miR-181b-1. Conclusion:. In this paper, we first identified the miRNAs involved in the regulation under the condition of serum starvation, and preliminarily determined that the target genes. MiR-27a, miR-320miR-338 and miR-181b1 can mediate the degradation of their respective target mRNA, respectively. It is helpful to understand the biological characteristics of cell growth and apoptosis and its regulatory mechanism.
【学位授予单位】:天津医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:R3416

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 边春景;刘铁刚;刘霞;邵荣光;;microRNAs在动物体内的功能[J];医学分子生物学杂志;2005年05期

2 桂乐;吴翔;郭新;秦小同;魏美芳;景宏美;;前体脂肪细胞分化相关的miRNA表达变化[J];中国老年学杂志;2008年21期

3 刘俊;黄陈;江_";钟福全;;microRNA在胰腺癌中的研究进展[J];现代生物医学进展;2009年23期

4 王雪;王红静;;微小RNA与卵巢癌的研究进展[J];医学综述;2010年08期

5 刘东;陈云昭;李锋;;microRNA与食管癌关系的研究进展[J];现代生物医学进展;2010年05期

6 黄文涛;郭向前;戴甲培;陈润生;;MicroRNA,lncRNA与神经退行性疾病[J];生物化学与生物物理进展;2010年08期

7 高玉;吴晋晖;柳林;;哺乳动物视网膜microRNA的表达及功能[J];眼科新进展;2010年08期

8 吴微;杨欢;;MicroRNA与自身免疫性疾病[J];免疫学杂志;2010年12期

9 涂轶;梅金红;;乳腺癌相关microRNA研究进展[J];实用临床医学;2010年11期

10 胡庆伟;杜英;梅丽娜;邢建民;邓再兴;;微小RNA-200家族在子宫内膜癌中的表达及意义[J];中国预防医学杂志;2011年03期

相关会议论文 前10条

1 李鸿;屈晶晶;王睿;盛春君;程晓芸;王吉影;苏斌;柴尚玉;曲伸;;体外培养胰岛的microRNA表达谱及功能研究[A];中华医学会第十次全国内分泌学学术会议论文汇编[C];2011年

2 李炯;段德民;郑克孝;;新型非标记高通量microRNA芯片技术[A];第一届全国生物物理化学会议暨生物物理化学发展战略研讨会论文摘要集[C];2010年

3 王俊峰;李巍;吴小江;阮康成;;大鼠附睾microRNA表达谱的研究[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年

4 蒋义国;刘斌斌;;毒理学中的microRNA研究[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年

5 巩丽颖;孙开来;;两种microRNA在先心病心肌组织中的表达[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2011年

6 李梦龙;;Systematically analyze and select key features to microRNA precursors identification based on random forests[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年

7 徐晨;鲍坚强;李定;郭强苏;;microRNA-449在小鼠精子发生过程中的作用研究[A];中国解剖学会2011年年会论文文摘汇编[C];2011年

8 江建霞;蒋晶晶;曹家树;;白菜花粉发育及授粉受精过程相关microRNA筛选及验证[A];中国园艺学会2011年学术年会论文摘要集[C];2011年

9 刘娜;杨景华;张明方;;嫁接西瓜microRNA的鉴定以及表达差异研究[A];中国园艺学会2011年学术年会论文摘要集[C];2011年

10 王国坤;朱嘉琦;荆清;秦永文;;缺氧刺激影响心肌细胞释放microRNA[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年

相关重要报纸文章 前10条

1 陈英云 乔蕤琳;哈医大成功研发国内首例microRNA转基因及敲减小鼠模型[N];黑龙江经济报;2010年

2 聂松义;我国脾脏功能研究达世界先进水平[N];中国医药报;2001年

3 刘向;基因研究:从测序转入功能研究[N];中国医药报;2004年

4 记者 朱敏丽;医药城创新牛奶检测技术[N];泰州日报;2010年

5 记者 许晓惠;乳品中微小核糖核酸科研成果公布[N];中国食品质量报;2010年

6 赵绍华;给孩子减肥必须“饿一饿”[N];健康时报;2007年

7 胡德荣;阿片受体功能研究有了新发现[N];保健时报;2003年

8 白毅;我国计算生物学研究取得重要进展[N];中国医药报;2007年

9 中国社会科学院研究生院二○○五届硕士毕业生 谢礼晔;微痕分析在磨制石器功能研究中的初步尝试[N];中国文物报;2005年

10 包海山;鄂尔多斯文化是开拓创新的文化[N];鄂尔多斯日报;2007年

相关博士学位论文 前10条

1 崔熠;microRNA在砷致胚胎发育毒性中的作用机制研究[D];北京协和医学院;2011年

2 朱霓;血管内皮细胞microRNA的表达谱分析和功能研究[D];第二军医大学;2011年

3 王雷;胰管内乳头状粘液性肿瘤:临床特征与microRNA的差异表达[D];第二军医大学;2010年

4 王镇;食管黏膜鳞状上皮癌变相关microRNA的研究[D];北京协和医学院;2011年

5 侯晋;microRNA在病毒感染和肝细胞癌中的作用及相关机制研究[D];清华大学;2010年

6 骆黎静;人卵巢癌干细胞的分离、鉴定及其特异性microRNA的筛选[D];北京协和医学院;2011年

7 于曼丽;Let-7d对血管平滑肌细胞增殖调控的研究[D];第二军医大学;2011年

8 陈勇;microRNA-200c在胃癌SGC7901/CDDP细胞中的作用及其机制的研究[D];河北医科大学;2011年

9 于琦;雄激素受体在乳腺癌中表达意义和相关microRNA筛选的研究[D];天津医科大学;2010年

10 翁春华;血管生成素特异microRNAs的鉴定与功能分析[D];浙江大学;2010年

相关硕士学位论文 前10条

1 胡德亮;microRNA-19b在P19细胞向心肌细胞分化中的作用[D];南京医科大学;2011年

2 曹灵芝;Myostatin调控的microRNA的筛选[D];中国协和医科大学;2010年

3 宋永站;microRNA-200c对ZEB1表达影响及对肿瘤细胞侵袭迁移作用[D];江苏大学;2010年

4 曲婷;基于生物信息学方法的H1N1流感病毒致病及传播特性研究[D];吉林大学;2010年

5 吕赛群;基于microRNA调控靶向肿瘤细胞的溶瘤腺病毒的研究[D];浙江理工大学;2010年

6 张秀梅;韧带成纤维细胞成骨分化过程microRNA、mRNA和蛋白表达谱分析[D];济南大学;2011年

7 申健;人膀胱癌中DNA甲基化对microRNA-203表达机制调控及其功能研究[D];暨南大学;2011年

8 孙佃臣;低磷胁迫响应microRNA及靶基因的克隆和大豆遗传转化研究[D];中国农业科学院;2011年

9 吉娜;自发性高血压大鼠肥厚心肌和纤维化肾脏组织中microRNA-21的表达[D];中国医科大学;2010年

10 陈娟;靶向Livin的microRNA干扰对人卵巢癌细胞SKOV3体外作用的研究[D];河北医科大学;2010年



本文编号:1526779

资料下载
论文发表

本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/binglixuelunwen/1526779.html


Copyright(c)文论论文网All Rights Reserved | 网站地图 |

版权申明:资料由用户38f3a***提供,本站仅收录摘要或目录,作者需要删除请E-mail邮箱bigeng88@qq.com