多房棘球绦虫钙网蛋白结构和功能的生物信息学研究

发布时间：2024-06-24 20:04

　　为进一步研究多房棘球绦虫的致病性、药物靶点以及疫苗诊断试剂的开发提供理论依据,应用生物信息学方法预测分析多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis,Em)钙网蛋白(Calreticulin,CRT)的结构和功能。通过基因组数据库收集数据确定Em-CRT基因和氨基酸序列;利用生物信息学软件分别对Em-CRT进行蛋白质基本性质、翻译后修饰位点、功能域、亚细胞定位、二/三级结构、亲/疏水性、抗原表位以及进化关系等进行预测和分析。结果表明:Em-CRT基因转录本长度为1 188 bp,蛋白全长为395个氨基酸残基,分子量大小约为45.44 kDa,等电点(pI)为4.47,为稳定蛋白,亲水性较高,可溶于水;具有信号肽和信号肽酶剪切位点,为膜外蛋白;Em-CRT具有N端糖基化位点,酪氨酸激酶(TK)Ⅱ磷酸化位点,cAMP和cGMP依赖蛋白激酶磷酸化位点,N端肉豆蔻酰化位点,蛋白激酶C磷酸化位点,酪氨酸激酶磷酸化位点;二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主;Em-CRT具有良好的T,B细胞抗原表位。所以,Em-CRT对多房棘球绦虫个体发育具有重要的作用,且与多房棘球蚴感染免疫密...

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 数据准备
    1.2 蛋白质特性预测分析
    1.3 蛋白抗原表位分析
    1.4 分子进化分析
2 结果与分析
    2.1 Em-CRT蛋白基本性质
    2.2 CD4+T 细胞抗原表位结果
    2.3 CD8+T 细胞抗原表位结果
    2.4 B细胞抗原表位综合分析
    2.5 分子进化分析
3 讨论与结论



本文编号：3995704