西藏藏族结核分枝杆菌临床分离株的MIRU-VNTR基因多态性分析与评价
本文选题:结核分枝杆菌 + 基因型 ; 参考:《中国人兽共患病学报》2014年02期
【摘要】:目的了解西藏地区藏族人群中结核分枝杆菌24位点MIRU-VNTR的基因多态性及其评价。方法应用欧盟推荐的24位点MIRU-VNTR分型方法,将本次分型结果与MIRU-VNTRplus数据库进行比对,并应用BioNumerics5.0软件进行聚类分析。结果 577株结核分枝杆菌分为347种基因型,其中299株分为69个基因簇,另278株表现为独特的基因型。MIRU31、Qub11b2、Qub26、Qub4156c、Mtub21、MIRU20和MIRU26七个位点对西藏地区藏族人群中结核分枝杆菌临床分离株的分辨力较高,另17个位点的分辨力较低,其中MIRU24位点分辨率为0。结论西藏地区藏族人群中结核分枝杆菌MIRU-VNTR分型具有良好的多态性,且该地区以现代型结核分枝杆菌为流行优势菌。
[Abstract]:Objective to investigate the genetic polymorphism and evaluation of Mycobacterium tuberculosis 24 locus MIRU-VNTR in Tibetan population in Tibet. Methods using the 24 locus MIRU-VNTR typing method recommended by EU, the results were compared with the MIRU-VNTRplus database, and the cluster analysis was carried out by BioNumerics5.0 software. Results 577 strains of Mycobacterium tuberculosis were classified into 347 genotypes, of which 299 strains were divided into 69 gene clusters. The other 278 strains showed unique genotypes. MIRU31, Qub11b2OQub26Qub4156cU Mtub21, MIRU20 and MIRU26 had high resolution to clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis in Tibetan population in Tibet, and the resolution of the other 17 loci was lower, among which the resolution of MIRU24 locus was 0. Conclusion Mycobacterium tuberculosis MIRU-VNTR genotyping has a good polymorphism in Tibetan population in Tibet, and modern Mycobacterium tuberculosis is the most prevalent bacterium in this area.
【作者单位】: 西藏自治区第一人民医院感染科;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【基金】:国家自然科学基金项目(No.30860243)资助~~
【分类号】:R378
【参考文献】
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1 石荔;杨敏;Christine Pourcel;董海燕;尼玛彭多;张嫒媛;朗珍;吕冰;蒋毅;魏淑贞;范昕建;万康林;;MLVA和Spoligotyping用于西藏地区216株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型研究[J];中华微生物学和免疫学杂志;2007年08期
【共引文献】
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3 同重湘;刘志广;马建军;赵秀琴;曹文静;杨永红;吕冰;姜元;万康林;;甘肃省228株结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping分型研究[J];实用预防医学;2010年04期
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【二级参考文献】
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5 石荔;杨敏;Christine Pourcel;董海燕;尼玛彭多;张嫒媛;朗珍;吕冰;蒋毅;魏淑贞;范昕建;万康林;;MLVA和Spoligotyping用于西藏地区216株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型研究[J];中华微生物学和免疫学杂志;2007年08期
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,本文编号:1936726
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