人白细胞介素-38的特性分析及B细胞表位的预测

发布时间：2019-04-26 01:59

【摘要】：目的:为进一步了解人白细胞介素(IL)-38蛋白质的特性和B细胞表位,从GenBank中查得其序列,用生物信息学等方法预测人IL-38蛋白质的二级结构等特性,并对其B细胞表位进行预测。方法:应用ProtParam tool、ProtScale、Emini和Kolaskar等程序或方法,对IL-38的组成、理化特性、亲水性、柔韧性和可及性等进行分析,以进一步预测其二级结构和抗原表位。结果:IL-38的二级结构主要由无规则卷曲(44.08%)和β-折叠(39.47%)组成。其B细胞表位可能位于第26-36、45-55、78-98和124-143等氨基酸区段。结论:首次利用生物信息学方法对IL-38基因及其蛋白质结构进行了分析和预测,预测结果将有助于确定IL-38的B细胞表位,为IL-38基因功能的深入研究及研制IL-38单克隆抗体提供了理论依据。
[Abstract]:Objective: to further understand the characteristics of human interleukin-38 (IL)-38) protein and B-cell epitope, to obtain its sequence from GenBank, and to predict the secondary structure and other properties of human IL-38 protein by bioinformatics. B cell epitopes were predicted. Methods: the composition, physicochemical properties, hydrophilicity, flexibility and accessibility of IL-38 were analyzed by ProtParam tool,ProtScale,Emini and Kolaskar, so as to predict its secondary structure and antigen epitope. Results: the secondary structure of IL-38 was mainly composed of irregular crimping (44.08%) and 尾-fold (39.47%). The B cell epitopes may be located in amino acid regions 26-36, 45-55, 78-98 and 124-14. Conclusion: bioinformatics was used to analyze and predict the structure of IL-38 gene and its protein for the first time. The predicted results will be helpful to identify the B cell epitopes of IL-38. It provides a theoretical basis for the further study of the function of IL-38 gene and the development of monoclonal antibody against IL-38.
【作者单位】： 宁波大学医学院免疫学研究室;
【基金】：国家自然科学基金项目(“阻抑IL-33/ST2信号对慢性阻塞性肺疾病气道炎症的作用及机制”,No.81070034) 宁波市科技创新团队项目(“宁波市消化系统恶性肿瘤诊治新技术创新团队”,2011B82014) 浙江省教育厅科研项目(Y201327689) 宁波大学学科项目(XKL11D2112,XKL11D2113)资助
【分类号】：R392

【参考文献】

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【共引文献】

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8 邱炎;幽门螺杆菌尿素酶B抗原表位的鉴定[D];华中农业大学;2010年

9 尚勃;SARS病毒N蛋白特异性抗体的制备及其B细胞表位研究[D];中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）;2005年

10 张婷;抗人CD40单抗5C11抗原识别表位的初步研究[D];苏州大学;2011年

，

本文编号：2465655