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肺炎克雷伯菌突变株的分离和全转录组分析

发布时间:2019-09-25 23:05
【摘要】:目的筛选空间环境诱变的肺炎克雷伯菌突变株及并进行全转录组分析。方法利用Biolog生化反应板从搭载于神舟八号飞船的肺炎克雷伯菌中筛选突变株,然后采用高通量测序技术对突变株全转录组测序,原始测序数据经处理后进行基因表达注释和差异表达基因的基因本体功能及京都基因与基因组信号通路注释分析。结果空间搭载的肺炎克雷伯菌突变株在糖类代谢上出现差异,且该菌株有232个基因表达上调,1 879个基因下调,其主要同细菌的膜蛋白、转运相关功能、糖类的运输相关。结论获得一株空间环境诱导的肺炎克雷伯菌突变株且该菌株全转录组测序和注释清晰,为后续的功能研究奠定了基础。
【作者单位】: 解放军总医院南楼呼吸科;武警总医院呼吸科;深圳华大基因研究院;
【基金】:国家“973”重点基础研究计划(2014CB744400) 武器预研重点基金(9140A26040312JB10078) 载人航天领域项目(040203) 国家自然科学基金(81350020)~~
【分类号】:R378

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号:2541671

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