基于生物信息学的日本血吸虫糖代谢研究

发布时间：2020-07-07 22:04

【摘要】： 血吸虫感染引起的血吸虫病在全世界76个国家和地区流行，在中国只流行日本血吸虫病。目前，对于血吸虫的疫苗开发及新药的研制尚未取得突破性进展，而日本血吸虫糖酵解途径中存在多个潜在的疫苗靶点。保守的糖代谢途径存在于几乎所有生物物种中，并在细胞生长发育过程中发挥着至关重要的作用，其中部分成员还与血吸虫的免疫逃避有一定的关系。本研究采用生物信息学方法，利用已有的日本血吸虫转录组、蛋白质组和基因组数据，重建了日本血吸虫糖代谢途径，并与其他模式生物该途径进行了比较；共鉴定了94个日本血吸虫糖代谢途径成员，其中18个预测为全长序列。针对日本血吸虫糖代谢途径成员的系统发生分析，也证实了该代谢途径的高度保守性。值得一提的是，本研究在日本血吸虫中发现了多个在低等原核生物中存在，但是在后生动物中不存在的酶，这些酶将为日本血吸虫的疫苗开发及新药的研制提供候选靶分子。此外，本研究还发展了一种对日本血吸虫转录组的数据进行优化的方法，即通过对日本血吸虫转录组数据库的分析，在鉴定的日本血吸虫糖代谢途径候选成员中存在20条蛋白质序列片段，分别代表同一蛋白质的N端或C端片段，通过简单的RT—PCR实验，找到了其中5条蛋白质序列的中间缺失序列，并和相应的N端和C端片段拼接，获得全长序列，其中一条蛋白质序列递交到GenBank获得了登录号。该方法对其它物种的转录组数据的优化也具有很好的借鉴意义。综上所述，本研究鉴定的日本血吸虫糖代谢途径的分子成员将有助于我们更好地了解血吸虫的生长、发育、成熟等基本生理过程，并将有助于开发新的预防、诊断和治疗血吸虫病的手段。
【学位授予单位】：华中师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2007
【分类号】：R383
【图文】：

图11日本血吸虫GAPDH多序列联配l矛19.3·1MultiPlesequenceangnmentofs.声甲口月icumGAPDHwithotherGAPDHs.注:阴影部分表示与日本血.吸虫ERK相同(黑色)或相似(灰色)的残基，其中重要的催化残29

⑧硕士学位论文MASrl’ER’5THESIS酸与N末端结合，而其核昔底物，MgATP或MgADP与c末端相结合。10203040506O70日090H日a

图 4.2AAw27047和AAw27891及其它物种同源序列联配分析 Fig4.2MultisequeneesAlignmentofAAW27047andAAW27891withotherspeeies’ aldehydedehydrogenaseHsa::人类;Mmu:小鼠;Cfa:犬;Gga:鸡;Dme:果蝇Aga:蚊子Ame:蜜蜂Sj比N:日本血吸虫(AAW27O47);Sj屯C:日本血吸虫(AAW27891);39

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 ;关注糖代谢异常与动脉粥样硬化性心血管疾病[J];糖尿病天地(临床);2016年10期

2 林奉森;冯霖;乔玉芳;朱香清;;畲族人群糖代谢异常对早期动脉粥样硬化的影响[J];糖尿病新世界;2016年23期

3 林泉;彭经宙;黄津;;肝硬化并发糖代谢异常95例临床相关危险因素分析[J];福建医药杂志;2017年01期

4 王明明;;广场健身操锻炼对中老年人糖代谢指标及平衡能力的影响[J];中国老年学杂志;2017年11期

5 唐洪波;温珍平;雷建灵;;糖代谢异常与乳腺癌的相关性研究[J];世界最新医学信息文摘;2017年34期

6 杨保军;张丽平;殷洪山;王涛;;冠心病与糖代谢异常关系临床调查分析[J];河北医科大学学报;2017年07期

7 徐彤;于善良;栾霞;;青岛市城区中青年糖代谢异常相关因素的调查分析[J];双足与保健;2017年08期

8 魏军平;郑慧娟;赵静;魏t

本文编号：2745667