利用同位素标记相对和绝对定量技术筛查神经管畸形胚胎孕鼠血清差异蛋白质谱

发布时间：2020-10-23 13:09

　　 目的筛查神经管畸形相关血清标记物,为阐明神经管畸形的发病机制提供理论依据。方法应用维甲酸在大鼠神经管闭合的关键期(孕10 d,E10)给药,建立脊柱裂大鼠模型,选取致畸早期孕11、13 d (E11、E13)显性脊柱裂胚胎孕鼠和正常胚胎孕鼠血清各5例,应用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)和液相色谱质谱鉴定技术分析2组蛋白质,定量信息以蛋白的丰度比差异倍数1.5倍以上(P 0.05)为差异蛋白质。结果质谱共得到谱图157 422张,鉴定出390种蛋白质,发现E11维甲酸致畸组与正常对照组差异蛋白40种,E13维甲酸致畸组与正常对照组差异蛋白26种。结论筛选出致畸早期大量神经管畸形和正常孕鼠血清差异蛋白,差异蛋白通过直接或间接相互作用,促进或抑制神经管畸形的发生与发展。
【部分图文】：

·319·图4COG分类图Fig.4COGannotation图3GO分类图（参与生物学功能）Fig.3Geneontologyannotationbasedonbiologicalfunctions生素D结合蛋白前体［13］。提示iTRAQ标记技术用于蛋白质相对定量的比较研究有可比性和延续性。用iTRAQ标记技术对致畸早期E11、E13维甲酸致畸孕鼠血清进行相对定量分析，共鉴定出38个在畸形组中表达显著上调的蛋白和28个表达显著下调的蛋白。这些致畸早期差异蛋白可能参与NTDs的发生过程，有望作为NTDs产前诊断的标志物。在血清学中鉴定到的差异蛋白，从其GO分类可知这些蛋白质参与细胞进程、应激反应、生物功能调节、发育过程、信号转导等诸多方面的生物过程。所鉴定的差异蛋白中，部分是功能已知与畸形明确相关的分子，如14-3-3ε蛋白和PDI。14-3-3ε是哺乳动物神经系统正常发育所必需的一种蛋白质，该蛋白缺失或缺陷时，会发生脑死亡或严重大脑畸形［14］。PDI蛋白具有蛋白质转录后修饰、协助蛋白质折叠、装配、运输功能，进而抑制细胞凋亡、保护细胞、减少应激对器官造成的伤害等多种作用［15-16］。此外，还有很多新发现的蛋白，其中部分蛋白参与胚胎的正常发育。对这些蛋白进行进一步的验证分析和深入的体内外实验和功能验证研究，将有助于阐明这些蛋白参与和调控脊柱裂发生机制的方式，为NTDs产前诊断与新的靶向治疗打下基矗Biologicaladhesion（2.11%）Biologicalregulation（7.89%）Cellkilling（0.18%）Cellularcomponentorganizationorbiogenesis（6.14%）Cellularprocess（9.30%）Developmentalprocess（4.91%）Establishmentoflocalization（4.74%）Growth（1.05%）Immunesystemprocess（2.98%）Iocalization（5.09%）Iocomotion（2.11%）Metabolicproces

·319·图4COG分类图Fig.4COGannotation图3GO分类图（参与生物学功能）Fig.3Geneontologyannotationbasedonbiologicalfunctions生素D结合蛋白前体［13］。提示iTRAQ标记技术用于蛋白质相对定量的比较研究有可比性和延续性。用iTRAQ标记技术对致畸早期E11、E13维甲酸致畸孕鼠血清进行相对定量分析，共鉴定出38个在畸形组中表达显著上调的蛋白和28个表达显著下调的蛋白。这些致畸早期差异蛋白可能参与NTDs的发生过程，有望作为NTDs产前诊断的标志物。在血清学中鉴定到的差异蛋白，从其GO分类可知这些蛋白质参与细胞进程、应激反应、生物功能调节、发育过程、信号转导等诸多方面的生物过程。所鉴定的差异蛋白中，部分是功能已知与畸形明确相关的分子，如14-3-3ε蛋白和PDI。14-3-3ε是哺乳动物神经系统正常发育所必需的一种蛋白质，该蛋白缺失或缺陷时，会发生脑死亡或严重大脑畸形［14］。PDI蛋白具有蛋白质转录后修饰、协助蛋白质折叠、装配、运输功能，进而抑制细胞凋亡、保护细胞、减少应激对器官造成的伤害等多种作用［15-16］。此外，还有很多新发现的蛋白，其中部分蛋白参与胚胎的正常发育。对这些蛋白进行进一步的验证分析和深入的体内外实验和功能验证研究，将有助于阐明这些蛋白参与和调控脊柱裂发生机制的方式，为NTDs产前诊断与新的靶向治疗打下基矗Biologicaladhesion（2.11%）Biologicalregulation（7.89%）Cellkilling（0.18%）Cellularcomponentorganizationorbiogenesis（6.14%）Cellularprocess（9.30%）Developmentalprocess（4.91%）Establishmentoflocalization（4.74%）Growth（1.05%）Immunesystemprocess（2.98%）Iocalization（5.09%）Iocomotion（2.11%）Metabolicproces
【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：2853084