恒河猴增龄过程中miR-16-5p及靶基因在外周血白细胞中的表达变化
发布时间:2021-02-10 11:23
目的明确衰老相关microRNA与恒河猴增龄的相关性。方法将猴群参照人类增龄划分为幼年、成年、老年和长寿,提取外周血白细胞的总RNA;用real-time PCR检测外周血白细胞中的microRNA及VEGFA、GHR、TBP、INSR、CLOCK、IKBKB、PIK3R1、LRP2、SSTR3、IGF1R、BCL2、PPM1D、IRS1、MAPK8、ADCY5、APP、NFE2L1、BDNF和PEX5的表达;利用microRNA靶基因预测网站miRwalk、TargetSan、miRecords、miRDB预测miR-16-5p的靶基因,并与人类衰老基因库(http://genomics.senescence.info/)对接。结果在增龄过程中,恒河猴外周血白细胞中miR-16-5p的表达量随年龄增长而增加(P<0.001);多个网站对miR-16-5p靶基因预测得到539个潜在的靶基因,与人类衰老基因组库对接后有19个基因重合;有10个基因的mRNA在恒河猴增龄过程中存在差异表达,其中, IKBKB、PIK3R1、IRS1的表达随着年龄的增加逐渐下降。结论在自然衰老恒河猴的外...
【文章来源】:基础医学与临床. 2019,39(07)
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
mircoRNA在增龄恒河猴血液白细胞中的表达量变化A.real-timePCRanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup
RanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup图1mircoRNA在增龄恒河猴血液白细胞中的表达量变化Fig1ExpressionofmicroRNAinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)A.WaynediagramofmiR-16-5ptargetgenepredictedbymiRwalk,TargetSan,miRecordsandmiRDB;B.Waynedia-gramofmiR-16targetgeneandHumanAgeingGenomicResources图2增龄恒河猴血液白细胞中miR-16-5p靶基因的预测Fig2PredictionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys2.3自然增龄恒河猴外周血白细胞中miR-16-5p潜在的靶基因的表达变化情况检测了预测得到的19条mRNA在增龄恒河猴外周血白细胞中的表达,其中在样本中检测到了10条mRNA(其余未检测到)(图3):IGF1R和PEX5的表达均在幼年组、成年组和老年组中逐渐升高,在长寿组中降低,且相对于幼年组来说其表达量仅在老年组呈显著差异(IGF1RP<0.01;PEX5P<0.05)。而TBP(P<0.01),PIK3R1(P<0.05)仅在长寿组中显著降低,其余几乎没有变化;IKBKB的表达相对于幼年组来说在成年组(P<0.05),老年组(P<0.05)和长寿组(P<0.01)中均显著下降;IRS1的表达则在老年组(P<0.05),长寿组(P<0.05)中显著降低。CLOCK、BCL、APP和NFE2L1的表达量的差异在各组间则无统计学意义。3讨论衰老是生物体随年龄增长面临的机体各个功能的渐进性丧失,而非人灵长类在进化上最接近于人类,所以将恒河猴用作实验?
ma-2596PPM1Dproteinphosphatase,Mg2+/Mn2+dependent1D8493IRS1insulinreceptorsubstrate13667MAPK8mitogen-activatedproteinkinase85599ADCY5adenylatecyclase5111APPamyloidbetaprecursorprotein351NFE2L1nuclearfactorerythroid2-relatedfactor14779BDNFbrainderivedneurotrophicfactor627PEX5peroxisomalbiogenesisfactor55830Real-timePCRanalysisofmiR-16targetgeneinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood;*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001comparedwithinfantgroup图3增龄恒河猴外周血白细胞中miR-16-5p靶基因的验证Fig3DetectionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)计学意义,可能是由于APP还受其他因素调节。根据对19条mRNA的验证结果发现PIK3R1、IRS1和IKBKB很可能是miR-16-5p在外周血白细胞中的靶基因,分别与胰岛素信号通路及NFκB信号传导相关。胰岛素通路是调节糖代谢的重要通路,可以通过其受体IR及其受体底物IRS激活PI-3K/AKT信号通路来发挥功能。IRS1的缺失可以延长小鼠的寿命[9],其在脑部的异位磷酸化也与APP的异常聚集有关[10]。说明胰岛素通路与衰老有关,具体则可能是通过PI-3K/AKT通路及叉头转录因子(FoxO)完成的。FoxO能被AKT磷酸化后离开细胞核进入到泛素降解途径。而FoxO在核内可以与转录因子共同激活其基因的表达,通过保护机体免受氧化应激侵扰[11],增加受损蛋白的移除[12]999
本文编号:3027278
【文章来源】:基础医学与临床. 2019,39(07)
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mircoRNA在增龄恒河猴血液白细胞中的表达量变化A.real-timePCRanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup
RanalysisofmicroRNAinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=6);B.real-timePCRanalysisofmiR-16-5pinleucocytesofagingrhesusmonkeysblood(n=19);*P<0.001comparedwithinfantgroup图1mircoRNA在增龄恒河猴血液白细胞中的表达量变化Fig1ExpressionofmicroRNAinleukocytesofagingrhesusmonkeys(x±s,n=6)A.WaynediagramofmiR-16-5ptargetgenepredictedbymiRwalk,TargetSan,miRecordsandmiRDB;B.Waynedia-gramofmiR-16targetgeneandHumanAgeingGenomicResources图2增龄恒河猴血液白细胞中miR-16-5p靶基因的预测Fig2PredictionofmiR-16-5ptargetgenesinleukocytesofagingrhesusmonkeys2.3自然增龄恒河猴外周血白细胞中miR-16-5p潜在的靶基因的表达变化情况检测了预测得到的19条mRNA在增龄恒河猴外周血白细胞中的表达,其中在样本中检测到了10条mRNA(其余未检测到)(图3):IGF1R和PEX5的表达均在幼年组、成年组和老年组中逐渐升高,在长寿组中降低,且相对于幼年组来说其表达量仅在老年组呈显著差异(IGF1RP<0.01;PEX5P<0.05)。而TBP(P<0.01),PIK3R1(P<0.05)仅在长寿组中显著降低,其余几乎没有变化;IKBKB的表达相对于幼年组来说在成年组(P<0.05),老年组(P<0.05)和长寿组(P<0.01)中均显著下降;IRS1的表达则在老年组(P<0.05),长寿组(P<0.05)中显著降低。CLOCK、BCL、APP和NFE2L1的表达量的差异在各组间则无统计学意义。3讨论衰老是生物体随年龄增长面临的机体各个功能的渐进性丧失,而非人灵长类在进化上最接近于人类,所以将恒河猴用作实验?
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本文编号:3027278
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