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我国利什曼原虫伽师株有毒力和无毒力前鞭毛体定量蛋白质组学比较分析

发布时间:2021-03-07 10:36
  目的应用定量蛋白质组学方法比较我国利什曼原虫伽师株有毒力和无毒力前鞭毛体蛋白表达的差异。方法将分离于我国新疆伽师县黑热病患者婴儿利什曼原虫JS5有毒力株前鞭毛体和无毒力株前鞭毛体经酶解后进行液相色谱串联质谱(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)的非标记(Label-free)定量分析,利用MaxQuant软件查库,进行Label-free非标定量(LFQ)分析;每个样品重复3次质谱分析,只有1次有LFQ值的蛋白舍弃。结果本研究共鉴定蛋白3 994个,有毒力和无毒力株间差异蛋白为298个(差异倍数>1.2或差异倍数<0.83,P<0.05),其中利什曼原虫有毒力株前鞭毛体特有表达蛋白15个,无毒力株前鞭毛体特有表达蛋白23个,二者间表达丰度有显著差异蛋白260个,其中有毒力前鞭毛体表达上调蛋白(高表达)78个,表达下调蛋白(低表达)182个。这些差异表达蛋白中已鉴定功能的蛋白分别涉及糖与脂质代谢、核酸代谢、压力反应、细胞骨架形成、细胞周期与增殖等生物功能。结论利什曼原虫伽师株有毒力株和无毒力株... 

【文章来源】:中国人兽共患病学报. 2019,35(02)北大核心

【文章页数】:6 页

【部分图文】:

我国利什曼原虫伽师株有毒力和无毒力前鞭毛体定量蛋白质组学比较分析


图1利什曼原虫伽师有毒株和无毒株差异表达蛋白韦恩图

富集,蛋白,差异表达,生物合成


cellcompositionandmolecularfunctionenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain2.3差异表达蛋白通路富集分析对有毒株表达上调蛋白和下调蛋白分别进行信号转导通路富集分析,结果显示表达上调蛋白参与了核糖体、吞噬体、醚脂代谢等信号转导通路(图4);表达下调蛋白参与了丙酮酸代谢、次生代谢物的生物合成、抗生素的生物合成等信号转导通路(图5)。图4有毒株表达上调蛋白的通路富集图Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain图5有毒株表达下调蛋白的通路富集图Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3讨论本研究应用非标记高通量蛋白质组研究技术对分离于我国新疆伽师县致荒漠型黑热病的利什曼原虫有毒株和无毒株进行了蛋白质组学分析,共鉴定蛋白3994个,远高于其他蛋白质组方法鉴定的蛋白数[8]。本研究结果显示,298个蛋白在有毒株和无毒株间的表达存在差异(特异表达或表达丰度差异)。这些差异表达蛋白中确定功能的蛋白分别参与糖与脂质代谢、核酸代谢、压力反应、细胞骨架形成、细胞周期与增殖等活动。001中国人兽共患病学报2019,35(2)

富集,蛋白,差异表达,生物合成


ain2.3差异表达蛋白通路富集分析对有毒株表达上调蛋白和下调蛋白分别进行信号转导通路富集分析,结果显示表达上调蛋白参与了核糖体、吞噬体、醚脂代谢等信号转导通路(图4);表达下调蛋白参与了丙酮酸代谢、次生代谢物的生物合成、抗生素的生物合成等信号转导通路(图5)。图4有毒株表达上调蛋白的通路富集图Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain图5有毒株表达下调蛋白的通路富集图Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3讨论本研究应用非标记高通量蛋白质组研究技术对分离于我国新疆伽师县致荒漠型黑热病的利什曼原虫有毒株和无毒株进行了蛋白质组学分析,共鉴定蛋白3994个,远高于其他蛋白质组方法鉴定的蛋白数[8]。本研究结果显示,298个蛋白在有毒株和无毒株间的表达存在差异(特异表达或表达丰度差异)。这些差异表达蛋白中确定功能的蛋白分别参与糖与脂质代谢、核酸代谢、压力反应、细胞骨架形成、细胞周期与增殖等活动。001中国人兽共患病学报2019,35(2)

【参考文献】:
期刊论文
[1]不同种株利什曼原虫的比较蛋白质组学分析[J]. 沈成义,邓世山,张仁刚,张洁,敬保迁.  中国人兽共患病学报. 2009(05)



本文编号:3068927

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