中国HIV-1主要流行重组株B’/C Tat基因第一外显子序列特征和功能分析

发布时间：2021-03-11 21:28

　　本文报道了第二次全国HIV-1分子流调（2001-2002）主要流行重组株B′／C Tat基因第一外显子的序列特征。并把此次分子流调中的CRF07-BC Tat基因第一外显子变异情况与第一次全国分子流调（1996—1998）的CRF07-BC Tat基因第一外显子变异情况作了比较，同时用真核表达系统对CRF07-BC Tat基因第一外显子和其相应的LTR的相互作用进行了比较研究。 一．中国HIV-1主要流行重组株B′／C Tat基因第一外显子序列特征分析 经PCR扩增和测序共得到我国HIV-1 B′／C亚型Tat序列154条，其中CRF07-BC为120份，CRF08-BC为34份，两种亚型广泛分布在我国多个省市。两种类型重组株第一外显子氨基酸序列的差异主要为半胱氨酸富含区和核心区的变化。 二．两次全国HIV分子流行病学调查CRF07-BC重组株Tat基因变异特征分析 第二次全国HIV分子流行病学调查中CRF07-BC Tat基因第一外显子主要氨基酸变化表现在Tat蛋白的第7、10、39、57位点。其中第10位氨基酸的出现频率在第二次流调中已经出现明显变化，Se... 

【文章来源】：福建师范大学福建省

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
内容提要
Abstract
序言
第一部分 文献综述
    1 Tat及其编码的Tat蛋白的结构
    2 Tat对HIV增殖过程中转录的作用
        2.1 TAR RNA
        2.2 TAKs
        2.3 组氨酸乙酰转移酶
第二部分 材料与方法
    1 实验材料
        1.1 标本来源
        1.2 菌种和质粒
        1.3 主要试剂与工具酶
        1.4 主要仪器
        1.5 常见溶液配制
        1.6 PCR引物
        1.7 主要生物软件和互连网网上分析工具
    2 实验方法
        2.1 中国HIV-1主要流行B′／C重组株Tat基因第一外显子序列特征分析
        2.2 CRF07-BC重组株Tat基因第一外显子突变对功能影响分析
第三部分 结果与分析
    1 中国HIV-1主要流行B，／C重组株Tat基因第一外显子序列特征分析
        1.1 nested-PCR扩增结果
        1.2 基因序列测定
        1.3 中国HIV-1主要流行重组株样本来源、亚型及数量统计
        1.4 基因距离分析
        1.5 系统树分析
        1.6 重组方式分析
        1.7 共享序列分析
        1.8 氨基酸变化情况分析
        1.9 共享序列三维结构预测分析
    2 两次全国HIV分子流调CRF07-BC重组株Tat基因变异特征分析
    3 CRF07-BC重组株Tat基因第一外显子突变对功能影响分析
        3.1 Tat基因第一外显子及LTR基因的扩增
        3.2 Tat基因第一外显子及LTR基因的克隆
        3.3 质粒转染及荧光素酶活性的检测
第四部分 小结与讨论
参考文献
中文摘要
附录1 全国第二次流调部分HIV-l CRF07-BC Tat蛋白序列
附录2 全国第二次流调部分HIV-1 CRFOB-BC Tat蛋白序列
附录3 在学期间发表和完成的论文
致谢



本文编号：3077123