宿主遗传信息对肠道微生物菌落成员的影响

发布时间：2017-04-18 12:02

  本文关键词：宿主遗传信息对肠道微生物菌落成员的影响，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：近年来,很多研究都在关注肠道菌群的定植影响因素,但是,关于遗传因素是否起作用仍未得到一个明确的答案。大部分研究报导,相比于其他因素(例如食物,生活方式以及年龄等),宿主遗传信息对肠道菌群的影响较小。随着越来越多的16S rRNA测序数据的产生,本文收集并重新分析了公共数据库的16SrRNA扩增子高通量测序数据,提供样品的个体来自五个大洲,包括亚洲人,非洲人,欧洲人,南美洲人,北美洲人,年龄从初生儿到87岁的老年人。我们的分析从肠道菌群的结构和成员两个方面分别进行,揭示遗传因素和非遗传因素影响肠道菌群结构和成员的程度不同,宿主遗传信息主要控制微生物在肠道中能否定植,而非遗传因素,例如饮食,主要调节特定微生物的含量。并且,通过比较不同哺乳动物的肠道菌群发现,如果哺乳动物的基因组越接近人类,那么它们的肠道菌群成员同样也会更加接近人类。此外,在追踪分析不同个体肠道菌群发展过程中,我们发现,对于健康成年人,肠道菌群成员长期稳定,而对于婴幼儿,肠道菌群成员随着年龄的增长而变化。我们的工作不仅明确了遗传因素和环境因素对肠道菌群的作用,而且指出不能直接比较遗传因素和环境因素对肠道菌群形成的贡献,为理解肠道菌群多样性和肠道菌群如何通过改变自身组成成分应对外界环境的变化提供了新的理论基础。
【关键词】：肠道菌群成员 肠道菌群结构 遗传因素 环境因素 高通量测序
【学位授予单位】：华东师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R37
【目录】：

• 摘要6-7
• ABSTRACT7-10
• 第一章 绪论10-12
• 第二章 肠道菌群的研究12-22
• 第一节 肠道菌群的功能12-15
• 一、肠道菌群与营养物质14
• 二、肠道菌群与致病菌14
• 三、肠道菌群与免疫系统14-15
• 四、肠道菌群与肿瘤15
• 五、肠道菌群与炎症性肠病15
• 六、肠道菌群与肥胖15
• 第二节 影响肠道菌群的因素15-18
• 一、饮食与肠道菌群17
• 二、遗传信息与肠道菌群17
• 三、年龄与肠道菌群17-18
• 第三节 高通量测序技术的主要应用范围18-20
• 一、全基因组测序19
• 二、外显子组测序19
• 三、转录组测序19
• 四、宏基因组测序19-20
• 第四节 16S rRNA测序技术20-21
• 第五节 本文研究的意义21-22
• 第三章 16S rRNA扩增子高通量数据分析22-41
• 第一节 材料与方法22-27
• 一、16S rRNA数据集22-23
• 二、生物信息分析流程23-27
• 第二节 结果与讨论27-39
• 一、肠道微生物的存在与否受遗传信息的调控27-32
• 二、非遗传因素对肠道菌群的影响32-36
• 三、遗传相似性与非加权unifrac距离成正比36-37
• 四、讨论37-39
• 第三节 结论39-41
• 一、结论39-40
• 二、本文的创新之处40
• 三、展望40-41
• 参考文献41-46
• 附录46-47
• 在学期间所取得的科研成果47-48
• 致谢48

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本文编号：314807