一起聚集性发热疫情中柯萨奇病毒A组2型的鉴定及基因特征分析

发布时间：2022-01-01 12:42

　　肠道病毒（Enterovirus,EV）可以引起包括手足口病的全身各系统的病症,柯萨奇病毒A组2型（Coxsackievirus A2,CV-A2）在世界范围广泛流行。我们对2018年北京市丰台区一起聚集性发热疫情进行病原学鉴定和基因特征分析,为该类疫情的防控提供实验室支持。采集6例病例的咽拭子标本,进行EV实时荧光RTPCR检测,结果显示5份为EV阳性。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,分离到4株EV,通过EV分支分型方法,确定这4株EV为CV-A2。4株CV-A2分离株的VP1区核苷酸序列和VP4区核苷酸序列相似性高达99.5%～100%,基因进化树图分析显示,4株CV-A2与D基因型代表株处于同一分支,与2017年中国天津分离株MG926808核苷酸同源性最高,为99.1%～99.3%。根据以上结果,确定此次聚集性发热疫情是由CV-A2感染引起,且属于在我国流行的D基因型,提示我们在以后的工作应结合流行病学资料,加强对CV-A2的监测。 

【文章来源】：病毒学报. 2019,35(04)北大核心CSCD

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
材料与方法
    1标本来源
    2标本初筛
    3病毒分离和鉴定
    4 VP1区和VP4区基因扩增
    5序列分析
结果
    1标本核酸检测初筛
    2病毒分离与鉴定
    3 VP1编码区和VP4编码区核苷酸相似性分析
    4进化分析
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]柯萨奇病毒A组2型江苏分离株（JS16-80）全基因组序列分析[J]. 杨倩,严冬梅,张勇,樊欢,嵇红,冀天娇,宋洋,许文波.  病毒学报. 2018(05)
[2]海淀区2012—2016年30起学校聚集性发热疫情调查[J]. 邢彦,华伟玉,刘锋,李婕.  海峡预防医学杂志. 2018(01)
[3]2013-2015年上海市浦东新区聚集性发热疫情分析[J]. 陈诹,王远萍,徐红梅,叶楚楚,朱渭萍.  实用预防医学. 2017(05)
[4]2014-2016年柳州市重症手足口病柯萨奇病毒A2型病毒株基因特征分析[J]. 黄萍,陈柳军,余钧池.  中国病毒病杂志. 2017(02)
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本文编号：3562308