一株引起严重急性呼吸道感染病例的A亚型人呼吸道合胞病毒全基因组基因特征分析

发布时间：2022-02-19 19:02

　　人呼吸道合胞病毒（Human respiratory syncytial virus,HRSV）是导致儿童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根据对单克隆抗体的反应,HRSV分为A、B两个亚型。为探讨严重急性呼吸道感染（Severe acute respi-ratory infection,SARI）病例中HRSV全基因组基因特征,本研究对2017年河南省漯河市住院SARI病例中检测到的1株HRSV A亚型病毒通过Sanger测序方法对其全基因组序列进行了测定和分析。通过Sequencher 5.4.5、MEGA 5.05、BioEdit 7.0.5等生物信息学软件进行序列拼接和比对,进行了基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。基于HRSV全基因组序列和11个单个蛋白基因序列构建的亲缘性关系分析结果提示本研究中检测到的这株HRSVA病毒（RSVAs/Luohe.Henan/CHN/42.17）属于ON1基因型,该型是我国近年流行的优势基因型。该病毒全基因组序列与35条全球代表株的核苷酸和氨基酸同源性分别为92.69%～99.82%和93.63%～99.67%;G蛋白编码区... 

【文章来源】：病毒学报. 2019,35(01)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
材料与方法
    1标本来源
    2病毒RNA提取
    3 HRSV G蛋白HVR2靶基因测定
    4 HRSV全基因组序列扩增和测定
    5序列分析
    6全球代表株。
结果
    1 RSVAs/Luohe.Henan与HRSV各个基因型代表株在HVR2区的基因亲缘性关系分析
    2 RSVAs/Luohe.Henan和10个基因型代表株HRSV全基因组核苷酸和氨基酸同源性分析
    3 RSVAs/Luohe.Henan和35株全球代表株的核苷酸和氨基酸变异分析
    4 RSVAs/Luohe.Henan病毒的G蛋白和F蛋白糖基化位点分析
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]2008～2014年中国8省市流行的人呼吸道合胞病毒A亚型G蛋白编码基因全长序列分析[J]. 宋金华,王慧玲,石晶,崔爱利,杨子峰,孙利伟,于德山,张蕾,张红,张燕,许文波.  病毒学报. 2017(06)
[2]郴州地区5岁以下住院儿童严重急性呼吸道感染病毒病原学研究[J]. 吴琼,陈礼娟,黄新泉,欧书腾,刘子菁,范楚平.  医学理论与实践. 2017(07)
[3]全国住院严重急性呼吸道感染病例哨点监测阶段性分析[J]. 彭质斌,郑建东,姜慧,秦颖,杨娟,余宏杰,冯录召.  疾病监测. 2017(01)
[4]广州地区2011-2013年儿童呼吸道合胞病毒流行特征分析[J]. 谢嘉慧,华亮,钟家禹,张莹莹,陈翊,刘晓敏,连广琬,周珍文,朱冰.  中华生物医学工程杂志. 2015 (03)
[5]苏州地区5岁以下严重急性呼吸道感染（SARI）住院患儿的病毒病原学和临床特征分析[J]. 江艳微,华军,吴婧,王丹,李莺,丁云芳,张涛,赵根明.  复旦学报(医学版). 2013(04)



本文编号：3633450