一株ST477型单增李斯特菌的全基因组测序及inlA基因遗传多样性

发布时间：2024-05-11 05:12

　　【背景】单增李斯特菌是一种重要的条件致病菌,不同型别菌株在宿主范围和毒力等方面存在差异。内化素基因inlA在入侵宿主上皮细胞中具有重要作用。【目的】研究单增李斯特菌序列型(Sequence type,ST)为477菌株的基因组特征及内化素基因inlA的遗传多样性。【方法】使用相关软件对测序数据进行多位点序列分型(Mutilocussequencetyping,MLST)、单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)及基因inlA遗传多样性分析。【结果】MLST进化分析结果显示,分离自不同国家的菌株具有较近亲缘关系。以分离自中国食品的ST477型菌株为参考菌株,通过SNP分析表明,加拿大食品中的ST9型菌株发生的突变位点最少(91-93个)。7株复合克隆系(Clonal complex,CC)为9的菌株其inlA基因序列间核苷酸相似性为29.8%-100%。【结论】初步分析了ST477型别菌株的进化及基因组特征,同时研究了部分CC9克隆系菌株inlA基因突变情况,为研究ST477型别菌株的进化及单增李斯特菌的毒力提供基础数据。

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【部分图文】：

图2单增李斯特菌MLST聚类分析图Figure2MLSTgeneticprofileofL.monocytogenesisolates

1104微生物学通报Microbiol.ChinaTel:010-64807511;E-mail:tongbao@im.ac.cn;http://journals.im.ac.cn/wswxtbcn图2单增李斯特菌MLST聚类分析图Figure2MLSTgeneticprofil....

图3基于7株单增李斯特菌全基因组SNPs进化分析Figure3Phylogeneticanalysisof7L.monocytogeneswholegenomeSNPs

)，一株ST9型与ST122型菌株聚为另一大类群(GroupII)。虽然目前没有明确的SNP标准规定菌株进化关系，但ST477菌株与3株来自加拿大食品菌株的SNP差异数最少，说明其亲缘关系较近。该结果与Zhang等[22]对分离自上海的单增李斯特菌基因组多样性进行研究的结果相似：....

图4基于7个单增李斯特菌的inlA序列的最大似然树Figure4Maximumlikelihoodtreeof7L.monocytogenes

1106微生物学通报Microbiol.ChinaTel:010-64807511;E-mail:tongbao@im.ac.cn;http://journals.im.ac.cn/wswxtbcn图4基于7个单增李斯特菌的inlA序列的最大似然树Figure4Maximumli....

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