埃及伊蚊表皮结构蛋白AaCPR100A的抗原表位的生物信息学预测
发布时间:2024-05-11 21:58
【目的】预测埃及伊蚊Aedes aegypti表皮结构蛋白AaCPR100A的抗原表位。【方法】通过DNAStar 8的Protean软件对埃及伊蚊表皮结构蛋白AACPR100A的二级结构和亲疏水性、表面可及性、柔韧性等特性进行分析,预测其潜在的B细胞抗原表位和潜在的T细胞抗原表位。【结果】AaCPR100A蛋白的二级结构以转角和不规则卷曲为主,表面可及性、柔韧性较强,存在7个潜在的B细胞抗原表位,位于18-29、32-42、47-82、87-98、111-178、194-248氨基酸残基或其附近,同时有11个潜在的T细胞抗原表位,位于20-24、35-39、44-48、51-53、79-82、103-106、109-112、146-148、150-152、185-203、224-235氨基酸残基或其附近。【结论】AaCPR100A蛋白潜在的B细胞抗原表位有7个,潜在的T细胞抗原表位有11个,综合后有3个潜在抗原表位,预测结果将为进一步研究AaCPR100A蛋白的免疫学特性和功能奠定基础,并为蚊虫的控制提供潜在的靶标。
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【部分图文】:
本文编号:3970429
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图1信号肽预测Fig.1Predictionofthesignalpeptide
验抗原表位的特异性。2结果与分析2.1AaCPR100A氨基酸序列信号肽分析与二级结构预测AaCPR100A蛋白的氨基酸序列为:MFRFIVVSTLLVAASAQYNGYNRDPKTVAIVSEQRYLAGDGQFGAAYDQEDGTNFKEETDADGNRRGSYSYLDPSG....
图2二级结构预测Fig.2Predictionofthesecondarystructure
·286·应用昆虫学报ChineseJournalofAppliedEntomology56卷图2二级结构预测Fig.2Predictionofthesecondarystructure2.2特性分析与抗原表位预测通过Protean软件,对AaCPR100A蛋白亲水性分析、疏水性....
图3特性分析与抗原表位预测Fig.3Characteristicanalysisandpredictionofantigenepitope
·286·应用昆虫学报ChineseJournalofAppliedEntomology56卷图2二级结构预测Fig.2Predictionofthesecondarystructure2.2特性分析与抗原表位预测通过Protean软件,对AaCPR100A蛋白亲水性分析、疏水性....
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