串联质谱蛋白质鉴定方法的研究

发布时间：2025-02-06 16:21

　　随着人类基因组计划的完成,蛋白质组学已成为后基因组时期的国际主攻领域,是生命科学的新的生长与发展点。质谱技术的飞速发展使得shotgun MS/MS成为蛋白质组学的核心技术,特别对于蛋白质复合物的鉴定,蛋白质互联网的解析,信号转导途径的分析,代谢途径的重构以及细胞行为的模拟等方面会有重大的应用。利用串联质谱数据进行蛋白质鉴定是这些应用的基础,因而也是极富挑战性的课题。 用串联质谱(tandem mass spectrometry, MS/MS)可以进行多肽的从头测序(de novo sequencing),并搜索数据库以鉴定蛋白质。我们用图论以及实验谱-理论谱联配(alignment)的方法对串联质谱得到的实验谱进行从头解析,得到了可靠的多肽序列,并应用到数据库搜索中鉴定了相应的蛋白质。同时,还用统计的方法对SwissProt以及TrEMBL蛋白质数据库进行了详细的分析。结果表明,3个四肽或者2个五肽或者1个八肽一般可以唯一地确定一个蛋白质。 目前,已有多种对串联质谱与数据库中多肽的理论谱的一致性进行评估的高通量计量算法用于鸟枪法蛋白质组学(shotgun...

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【部分图文】：

图2-6鉴定到的酵母蛋白质组和预测的酵母蛋白质组的CAI分布

第二章蛋白质复杂体系分级及鉴定方法的研究第一节采用液相等电聚焦与二维液相色谱串联质谱联用方法进行大规模的蛋白质分级及鉴定LIEF-2D-LC-MS/MS方法中所鉴定到的蛋白质的CAI值主要集中在0.1-0.2之间，CAI值小于0.2的蛋白质占61.45%（1....

图2-11本部分实验中鉴定到蛋白质与Charlesriverlaboratorieswebsite发表的血浆生物标志物进行比较分析

白质复杂体系分级及鉴定方法的研究及其在糖尿病相关的血清标志物发现中的应用蛋白质进行二维液相色谱串联质谱分析之前应该采用大上样量策略，使得更多的低丰度蛋白质被检测到。浆中的低丰度蛋白质和生物标志物质组学平台的发展使得从临床样本中鉴定新的生物标志物成将3036种鉴定到的血浆蛋白....

图5不同产地、不同蜜源蜂王浆的2-DE图谱

中国食品学报2017年第10期（d）油菜（重庆）（e）洋槐（宁夏）（f）向日葵（新疆）图5不同产地、不同蜜源蜂王浆的2-DE图谱Fig.5Imagesof2-DEofRJfromdifferentproducingareaandnectarsource3结论本研究应用双向电泳和M....

图2.6可以看到，在b离子可靠性分布图中除了有效的b离子外，还有很

econstructionofpeptidesequenceVLPVPQKfromN-terminalreliability可以看到，在b离子可靠性分布图中除了有效的b离子位点，这必然导致除了重建出真实序列外，还有很多序列排名前10位见表2.5（共得....

本文编号：4030573