基于生物信息学分析微小隐孢子虫含WD40结构域的蛋白功能

发布时间：2017-08-15 15:38

  本文关键词：基于生物信息学分析微小隐孢子虫含WD40结构域的蛋白功能

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【摘要】：目的对微小隐孢子虫中含WD40结构域的蛋白进行生物信息学分析,分析该蛋白家族的WD40结构并预测其功能,为微小隐孢子虫基因功能的研究提供一定的基础理论。方法通过隐孢子虫基因组数据库收集数据,获得微小隐孢子虫含WD40结构域蛋白家族的序列信息,搜索每个蛋白的CDD结构域并进行NCBI BLAST比对分析,确定为WD40结构域家族蛋白,分析结构域并预测功能。结果在C.parvum Iowa II中共搜索到50个含有WD40结构域的蛋白,其中cgd1_1930、cgd5_740和cgd4_3360含有CAF1C_H4-bd超家族结构,可能参与DNA修复和DNA复制过程;cgd4_260含有ACE1-Sec16-like超家族,可能参与囊泡的形成和物质运输;cgd1_2600含有TAF5_NTD2结构域,可能参与蛋白与蛋白的相互作用。结论在微小隐孢子虫中,WD40蛋白家族不仅可能单独发挥作用,而且还能通过相互辅助、结合发挥其生物效应。
【作者单位】： 暨南大学医学院;
【关键词】： 微小隐孢子虫 WD结构域 生物信息学分析 功能预测
【基金】：国家自然科学基金(No.30901249,No.81101267) 广东省自然科学基金(No.10151063201000036,No.S2011010002526) 暨南大学科研培育与创新基金(No.21612426)联合资助~~
【分类号】：R382.3
【正文快照】： 隐孢子虫(Cryptosporidiumspp.)是一种世界范围内广泛流行的人兽共患寄生虫[1],其中感染人的主要为微小隐孢子虫(Cryptosporidium par-vum)和人隐孢子虫(Cryptosporidium homi-nis)[2-3]。隐孢子虫主要寄生在消化道或呼吸道,在免疫功能正常者呈自限性感染;但在免疫功能低下的

【共引文献】

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本文编号：678992