蛋白质相互作用网络功能模块检测的研究综述

发布时间：2017-08-26 03:01

  本文关键词：蛋白质相互作用网络功能模块检测的研究综述

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【摘要】：蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络是生命活动中一种极其重要的生物分子关系网络,利用计算方法从PPI网络中检测功能模块是目前生物信息学中一项重要的研究课题.本文首先总结了功能模块检测过程的基本流程,说明了预处理和后处理的作用;其次,提出了一种模块检测方法的分类体系,并对其中一些代表性的检测算法进行了阐述;再次,给出了模块检测常用的数据库、评价指标和相关软件工具,并通过实验对代表性算法进行了性能对比.最后,通过对该领域挑战性问题的分析预测了模块检测未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考.
【作者单位】： 北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室;
【关键词】： 蛋白质相互作用网络 功能模块检测 检测流程 分类体系 性能对比
【基金】：国家重点基础研究发展计划(973计划)(2014CB744601) 国家自然科学基金(61375059,61332016) 教育部博士点学科专项科研博导类基金(20121103110031) 北京市教委科研计划重点项目(北京市自然科学基金重点B类项目)(KZ201410005004)资助~~
【分类号】：Q51;R3416
【正文快照】： 随着人类基因组计划的完成,蛋白质组学的研究已经成为生命科学乃至自然科学领域中最重要的研究课题之一.蛋白质组学是一种对蛋白质所含特 性进行系统化研究的学科,其研究目的是为生物系统在健康和疾病状况下的结构、功能和调控提供详细的描述.由于蛋白质很少以独立个体的方式

【参考文献】

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【相似文献】

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本文编号：739232