江西部分地区303株结核分枝杆菌基因分型研究

发布时间：2017-08-30 23:21

  本文关键词：江西部分地区303株结核分枝杆菌基因分型研究

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【摘要】：目的选取2008年-2009年间由南昌市疾病预防控制中心收集的江西省部分地区结核分枝杆菌临床分离株,通过多位点可变数目串联重复序列分型,了解南昌市结核分枝杆菌流行菌株基因分型情况。方法对临床分离株进行常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)分别对15个VNTR位点进行检测分析,基因聚类分析采用BioNumeics软件。结果经聚类分析,303株结核分枝杆菌分为4个基因群(I群、Ⅱ群、Ⅲ群、Ⅳ群)119个基因型。聚类分析得知,Ⅰ群占86.47%,可分成91个基因型;Ⅱ群占3.96%,可分成6个基因型;Ⅲ群占4.95%,可分成11个基因型;Ⅳ群占4.62%,可分成11个基因型。结论江西部分地区的结核分枝杆菌存在基因多态性,其主要流行型为Ⅰ型。
【作者单位】： 江西省疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室;北京市朝阳区疾病预防控制中心;南昌市疾病预防控制中心;
【关键词】： 结核分枝杆菌 基因分型
【基金】：国家科技重大专项(2008ZX100/03-101-02,2011ZX10004-001)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： 我国是结核病高疫情国家,结核病威胁着我国人民的身体健康。结核病是由结核分枝杆菌感染引起的,通过对结核分枝杆菌的基因分型,可以发现现患病例、新病例、特定传播环境间的关系,更易检测出不同辖区间病人的传播,进行流行病学分析。可变数目串联重复序列(VNTR)分型是基于对包

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 郑晓静;郑素华;杜博平;贾红彦;李卫民;丁北川;王u&民;张宗德;;多位点可变数量串联重复序列分析在北京家族结核分枝杆菌基因分型中的应用及位点筛选[J];临床肺科杂志;2010年07期

2 苏云开;余琴;吕冰;马岩;连璐璐;杨晓敏;董海燕;刘耀;赵秀芹;吴移谋;万康林;;内蒙古地区结核分枝杆菌串联重复序列基因多态性分析[J];疾病监测;2013年04期

3 李墨;焦伟伟;孙桂芝;Igor Mokrousov;郭雅洁;申阿东;;不同VNTR位点组合用于北京基因型结核分枝杆菌基因分型的研究[J];中国人兽共患病学报;2008年06期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前9条

1 陈志;陈佳;先德强;周云;郑幸福;江智辉;;79株结核分支杆菌基因分型研究及耐药相关分析[J];重庆医学;2012年23期

2 李玉新;王鸣秋;周丽平;赵丁源;侯双翼;汪小黎;;一起学校结核病暴发疫情临床株基因同源性分析[J];公共卫生与预防医学;2013年03期

3 戴广明;黄海荣;梁倩;姜广路;逄宇;周杨;王胜芬;赵雁林;李卫民;;新疆维吾尔自治区与甘肃省部分地区结核分枝杆菌分子流行病学特征比较研究[J];疾病监测;2011年08期

4 陈志;陈佳;李六林;先德强;岳蕴瑶;江智辉;周良君;;应用VNTR技术对绵阳地区结核分枝杆菌进行基因分型[J];中华疾病控制杂志;2011年09期

5 朱学彬;李世明;张金玲;宋磊;张中瑞;贺蕾;高丽;史哲;冯福民;;唐山市人群结核分枝杆菌基因型分析[J];中华疾病控制杂志;2013年06期

6 谢彤;巨韩芳;赵德福;穆成;赵慧;吴振萍;王撷秀;;天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究[J];天津医药;2010年11期

7 刘美伶;王学高;周碧波;陆怀初;杨尚波;蒋伟利;刘媛;王伟炳;;华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征[J];复旦学报(医学版);2013年04期

8 陈求扬;梁庆福;林建;林淑芳;赵永;魏淑贞;逄宇;郑金凤;王玉锋;赵雁林;;福建省耐多药结核分枝杆菌MLVA分型分析[J];中国公共卫生;2013年01期

9 孙小军;金法祥;王华钧;;绍兴地区结核分枝杆菌临床分离株Rep-PCR基因分型研究[J];中华医院感染学杂志;2013年18期

中国硕士学位论文全文数据库 前3条

1 谷勇;水稻白叶枯菌MLVA基因分型方法的建立[D];华中农业大学;2011年

2 李元春;基于分子标记的山核桃生殖特性研究[D];浙江农林大学;2011年

3 张思潮;湖州市结核分枝杆菌基因分型特征研究[D];浙江大学;2009年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 刘佳文;申阿东;孙桂芝;;耐异烟肼结核分枝杆菌临床分离株耐药基因突变及其分子流行病学调查研究[J];临床肺科杂志;2007年06期

2 全国结核病流行病学抽样调查技术指导组;第四次全国结核病流行病学抽样调查报告[J];中华结核和呼吸杂志;2002年01期

3 柴利泉;李卫民;李丽;戴宗甲;白大鹏;张立;邵世峰;吴琦;陆伟;孙照刚;李传友;;天津地区临床分离结核分枝杆菌分型的初步研究[J];中华流行病学杂志;2007年08期

4 曹晓慧;刘志广;赵秀芹;吕冰;张媛媛;万康林;;220株结核分枝杆菌北京临床分离株的基因分型研究[J];中国人兽共患病学报;2008年05期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 王博;袁燕莉;郭建华;刘志广;王艳华;杨修军;万康林;;应用VNTR技术对吉林省结核分枝杆菌基因分型的研究[J];中国卫生检验杂志;2009年06期

2 石荔;杨敏;Christine Pourcel;董海燕;尼玛彭多;张嫒媛;朗珍;吕冰;蒋毅;魏淑贞;范昕建;万康林;;MLVA和Spoligotyping用于西藏地区216株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型研究[J];中华微生物学和免疫学杂志;2007年08期

3 王东;冯福民;刘茜;郭梅;曹燕花;李世明;么作义;高宝霞;孙永红;;RAPD技术在唐山市结核分枝杆菌指纹分型研究中的应用[J];现代预防医学;2007年17期

4 同重湘;赵秀琴;马建军;刘志广;曹文静;杨永红;吕冰;姜元;万康林;;228株结核分枝杆菌MLVA分型研究[J];中国医药导报;2010年16期

5 赵玉玲;赵东阳;李辉;杨洪毅;马晓光;;河南省部分地区结核分枝杆菌散在分布重复单位及多位点串联重复序列(MIRU-VNTR)基因分型技术的研究[J];现代预防医学;2011年14期

6 同重湘;赵秀芹;马建军;刘志广;曹文静;杨永红;吕冰;姜元;万康林;;甘肃省临床分离结核分枝杆菌MLVA分型初步研究[J];中国人兽共患病学报;2010年07期

7 綦迎成;刘洁;鱼栓民;李君莲;赵秀芹;王泉;刘志广;吕冰;刘中华;万康林;;新疆结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping基因型的初步研究[J];疾病监测;2010年12期

8 杨修军;万康林;王艳华;赵秀琴;郭建华;张媛媛;王春生;;应用Spoligotyping技术对吉林省结核分枝杆菌基因分型的研究[J];中国卫生工程学;2008年06期

9 赵玉玲;赵东阳;李辉;杨洪毅;马晓光;赵国强;;河南省结核分枝杆菌基因分型与耐药性分析[J];临床检验杂志;2011年03期

10 车洋;董红军;于梅;;VNTR技术用于宁波地区结核分枝杆菌基因分型的初步研究[J];中国卫生检验杂志;2010年12期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 王u&民;郭艳铃;刘洋;;结核分枝杆菌基因分型技术[A];2005年中国防痨协会全国学术会议论文集[C];2005年

2 司红艳;甘培尚;杨枢敏;李苗;景涛;张颖;祝秉东;张文宏;;甘肃省甘南、定西两州市耐异烟肼和利福平结核分枝杆菌MIRU基因分型研究[A];中华医学会2008年全国结核病学术会议论文汇编[C];2008年

3 刘梅;;MLVA、spoligotyping技术应用于结核分枝杆菌基因分型的初步研究[A];中华医学会结核病学分会2010年学术年会论文汇编[C];2010年

4 秦莲花;郑瑞娟;刘忠华;王洁;胡忠义;;寡核苷酸(cag)5分子标记物在分枝杆菌菌株鉴定中的应用研究[A];中国防痨协会临床委员会、中国防痨协会基础委员会学术研讨会论文集[C];2008年

5 王博;柴利泉;戴宗甲;李卫民;;基因分型及其在牛结核流行病学中的应用[A];中华医学会结核病学分会2006年学术会议论文汇编[C];2006年

6 张璐;陈婧;高谦;董海燕;万康林;沈鑫;桂晓红;梅建;;适合我国结核分枝杆菌菌株基因型分型的方法[A];中华医学会结核病学分会2006年学术会议论文汇编[C];2006年

7 刘毅;李卫民;田苗;孙照刚;李传友;周辉;张治国;高铁杰;高峰;;快速筛选定义北京基因型结核分枝杆菌的新方法[A];2007年中国防痨协会全国学术会议论文集[C];2007年

8 李丽;柴利泉;白大鹏;张立;邵世峰;吴琦;陆伟;李卫民;戴宗甲;孙照刚;李传友;;天津地区临床分离结核分枝杆菌分子流行病学研究[A];2007年中国防痨协会全国学术会议论文集[C];2007年

9 李丽;柴利泉;戴宗甲;白大鹏;张立;邵世峰;吴琦;陆伟;孙照刚;李卫民;李传友;;天津地区结核分枝杆菌临床分离菌株基因分型特征的研究[A];中华医学会结核病学分会2006年学术会议论文汇编[C];2006年

10 孙照刚;张旭霞;李研;张建源;田苗;刘毅;李传友;;严重耐多药结核分枝杆菌的部分特点研究[A];中国防痨协会临床委员会、中国防痨协会基础委员会学术研讨会论文集[C];2008年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 顾蓓红;基因分型抗病毒有的放矢 PEG干扰变异者难逃“罗”网[N];科技日报;2003年

2 卢维;丙肝检测添基因分型手段[N];健康报;2003年

3 刘云涛;TP53基因R72P多态又嗜酒者易患结直肠癌[N];中国医药报;2007年

4 李跃军 周旭娅;国内首张“基因型身份证”问世[N];医药经济报;2002年

5 中原;检测触珠蛋白基因型[N];医药经济报;2002年

6 吴一福;MTHFRC667T基因分型技术问世[N];中国医药报;2005年

7 ;产质粒介导Ⅰ型头孢菌素酶细菌的耐药性及基因型研究[N];中国医药报;2003年

8 记者 韩晓玲　通讯员 范敬群 金安江;华中农大研究成果获世界声誉[N];湖北日报;2009年

9 周菁;痰湿体质者低密度脂蛋白受体基因PvuII、AvaII多态性关系研究[N];中国中医药报;2006年

10 张永t;北京创MN血型基因型测定法[N];中国医药报;2000年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 姜晓颖;北京地区结核分枝杆菌基因分型及与耐药性关系的研究[D];北京市结核病胸部肿瘤研究所;2012年

2 徐广宇;基于生物信息学的结核分枝杆菌分子流行病学调查及诊断靶标簇系统平台的建立[D];吉林大学;2013年

3 石荔;西藏自治区结核分枝杆菌临床分离菌株的基因分型初步研究[D];四川大学;2007年

4 邓艳琴;结核分枝杆菌基因分型及异烟肼新耐药突变位点的确认研究[D];福建医科大学;2009年

5 陈建;结核患者社会行为因素和结核分枝杆菌基因分型的初步研究[D];四川大学;2007年

6 胡屹;中国华东农村地区耐药结核病流行和传播的分子流行病学研究[D];复旦大学;2008年

7 李建红;沙眼衣原体高分辨率溶解曲线基因分型方法的建立及其在男男性行为者流行病学调查中的应用[D];北京协和医学院;2010年

8 董海燕;中国13省市结核分枝杆菌基因多态性分析[D];中国疾病预防控制中心;2011年

9 陈嘉臻;结核分枝杆菌特异的RD2/RD11蛋白应用于结核免疫诊断的研究[D];复旦大学;2009年

10 张瑞;人乳头瘤病毒基因分型检测参考物质及其应用研究[D];北京协和医学院;2013年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 文建强;甘肃省结核分枝杆菌临床分离株基因分型初步研究[D];兰州大学;2008年

2 赵玉玲;河南省结核分枝杆菌基因分型与耐药性和地区分布关系的研究[D];郑州大学;2011年

3 师庆红;丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义的研究[D];吉林大学;2007年

4 谭磊;基于PCR的牛源金黄色葡萄球菌基因分型研究[D];黑龙江八一农垦大学;2008年

5 刘彬彬;北京地区结核分枝杆菌的基因分型及北京家族进化的初步研究[D];中南大学;2012年

6 赵文瑾;HBV基因分型芯片的构建及临床初步应用[D];中国医科大学;2006年

7 蔡溢;结核分枝杆菌RmlA的表达、纯化以及酶促反应动力学研究[D];大连医科大学;2006年

8 郑琳琳;探针编码实时PCR的基因分型研究[D];厦门大学;2006年

9 王霞芳;IFN-γ增强BALB/c小鼠对结核分枝杆菌感染的抵抗力[D];苏州大学;2002年

10 曹立雪;应用膜芯片检测结核分枝杆菌rpoB基因突变[D];中国人民解放军军事医学科学院;2003年

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本文编号：762079