基于微卫星标记的不同壳型湖北钉螺小尺度景观群体遗传结构研究

发布时间：2017-08-31 13:37

  本文关键词：基于微卫星标记的不同壳型湖北钉螺小尺度景观群体遗传结构研究

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【摘要】：目的分析湖北松滋地区湖北钉螺小尺度景观群体的遗传结构。方法选择T6-17、P101、D11、B14、T4-33和C22等6对微卫星位点对松滋地区10个生境的湖北钉螺群体进行基因扫描,计算各群体的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、群体间的遗传分化系数(FST)和遗传距离,根据遗传距离进行聚类分析,并进行分子变异方差分析(AMOVA)。结果 10个钉螺群体经鉴定螺壳分为光壳和肋壳(包括浅肋和深肋),10个群体共检测到141个等位基因,各位点20-34个不等,平均每个位点检测到23.5个;6个微卫星位点的平均有效等位基因数为1.575,各位点的有效等位基因数并不平衡,且数值差异较大,范围从0.445至3.060。群体的平均Ho范围为0.438-0.698,在光壳的团山村群体中最低,在深肋型的马木口村群体中最高;群体的平均He范围为0.589-0.892,在浅肋型的德胜村群体中最低,在深肋型的马木口村群体中最高;成对群体间的Fst为-0.01564-0.25247,各群体的PIC为0.528-0.857,显示出高度多态性;AMOVA分析结果显示,变异主要存在于个体间,占总变异的88.4%;聚类分析结果显示,肋壳的马木口村、横堤村、义兴村三个群体与光壳的马狮子咀村、民主村、土桥村三个群体先聚为一支后,与浅肋的德胜村、木天河村两个群体与光壳的团山村、夹马槽村聚的一支合聚。结论松滋地区不同景观环境下湖北钉螺呈现不同螺壳形态,尽管遗传多样性较为丰富,但遗传变异主要来自个体间,不同螺壳形态的湖北钉螺群体间并未体现出明显的遗传分化。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所 卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室 世界卫生组织疟疾、血吸虫病和丝虫病合作中心;陕西师范大学生命科学学院;
【关键词】： 微卫星DNA 湖北钉螺 小尺度群体遗传结构
【基金】：国家自然科学基金项目(81101280) 国家科技重大专项(2012ZX10004220,2008ZX10004-011) 上海市公共卫生海外留学基金(GWHW201216)~~
【分类号】：R383.24
【正文快照】： 湖北钉螺(Oncomelania hupensis)是日本血吸虫唯一的中间宿主,我国大陆仅有一种,广泛分布于长江中下游地区[1-2]。由于其分布广泛、孳生环境复杂以及地理隔离的影响,湖北钉螺不同地理群体发生了显著的遗传分化和变异。近年来,随着湖北钉螺的群体遗传学、景观生态学等深入研究,

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本文编号：765907