CODEHOP RT-PCR技术在黄病毒属病毒筛查中应用

发布时间：2017-09-17 04:31

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【摘要】：为了探讨CODEHOP RT-PCR技术在黄病毒属病毒筛查中的应用效果,根据GenBank发表的不同黄病毒多聚蛋白氨基酸序列,利用CODEHOP方法设计合成一对简并引物,用一步RT-PCR对乙型脑炎病毒株JEV1201、登革热病毒株JKD001和黄热疫苗YV6161进行检测,扩增产物测序后进行BLAST同源性比对和系统分生分析。结果显示该方法可以特异的对黄病毒进行扩增,目的片段的大小和序列与预期结果相符,JEV1201与乙脑病毒株YL2009-4/YC2009-3同源性最为接近,位于乙脑病毒株进化树分支。JKD001与登革热病毒株DENV-2/ID/1022DN/1975同源性最为接近,位于登革热病毒株进化树分支。YV6161与黄热病病毒株17D同源性最为接近,位于黄热病病毒株进化树分支。由此可知CODEHOP RT-PCR技术可以被有效的用于对黄病毒属病毒的筛查、种类鉴定和分子溯源。
【作者单位】： 大榭出入境检验检疫局;中国检验检疫科学研究院;
【关键词】： 黄病毒 检测 CODEHOP RT-PCR
【分类号】：R373.9
【正文快照】： 黄热病病毒属病毒(Flavivirus)简称黄病毒,是黄病毒科的最大家族,已知由70多种病毒构成,其中40多种病毒与人类疾病相关,包括登革病毒(Dengue virus,DENV)、乙型脑炎病毒(Japaneseencephalitis virus,JEV)、蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV)、西尼罗病毒(West

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本文编号：867278