广西和越南北部HIV-1分子流行病学及耐药研究

发布时间：2024-03-10 18:15

　　第一部分广西和越南北部HIV-1分子流行病学研究背景和目的广西是我国艾滋病疫情较为严重的地区,而与广西接壤的越南北部地区也是该国艾滋病疫情相对严重的区域。既往研究表明广西-越南北部之间存在HIV-1毒株相互传播的可能,但多数研究是利用当地采集的HIV流行毒株与国际上公开的中国或者越南的HIV毒株序列进行进化分析得出的结果。近年来广西和越南北部HIV-1的传播途径和主要亚型已发生了一定的变化。到目前为止,尚未有同一时期在两地开展的较大规模的流行病学研究去明确两地的HIV-1毒株之间是否存在传播关系。当前,广西和越南的政治、经济、文化交流随着“一带一路”倡议的带动和日益密切的中国-东盟合作而日趋活跃,艾滋病相互传播的风险也加大。在此背景下,本研究的主要目的是通过同时收集两地艾滋病感染样本,分析当前两地HIV-1亚型的分布、基因变异和系统进化特征,以期了解广西和越南北部地区HIV-1的流行特征、基因变异和相互的传播关系。方法2016年-2017年,通过方便抽样,在广西(崇左市、防城港市、百色市、南宁市和柳州市)和越南北部(广宁省、凉山省、高平省和河江省)收集进行抗病毒治疗的艾滋病感染者作为研...

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图1-1广西和越南北部的pol基因序列的系统进化树分析

2018届博士论文广西和越南北部HIV-1分子流行病学及耐药研究2.广西和越南HIV-1基因亚型判定及分布情况首先使用NCBI提供的在线分析工具Genotyping分别对gag、pol和env序列进行初步亚型鉴定，再使用MEGA7.0绘制gag、po....

图1-3广西HIV-1样本基因亚型在各城市的分布

地区CRF01_AECRF08_BCCRF07_BCBCURFs总计南宁4.26（17/399）10.78（43/399）---0.75pp（3/399）15.79（63/399）百色3.76（15/399）15.04（60/399）0.75（3/399）--....

图1-4广西HIV-1样本基因亚型在性别方面的分布

图1-4广西HIV-1样本基因亚型在性别方面的分布Fig1-4ThesexdistributionofHIV-1subtypesinGuangxi2.3基因亚型的感染途径分布表1-3显示了广西HIV-1各基因亚型在传播途径方面的分布，已知亚型样....

图1-5样本NN-IDU-16pol区DNA序列的RIP分析结果

2018届博士论文广西和越南北部HIV-1分子流行病学及耐药研究置插入了B（B’）亚型片段，其余位置均为CRF01_AE亚型（图1-6）；此外，为了进一步确定样本在HIVDNA序列上具体的重组位置，我们又运用HIVDatabase提供的在线工....

本文编号：3925171