人感染高致病性H5N6禽流感病毒表面糖蛋白分子进化特征

发布时间：2024-03-31 05:53

　　目的对19例人感染高致病性H5N6禽流感病毒的血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)蛋白进行分子进化分析。方法运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序,从美国国家生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)和全球流感序列数据库(global initiative on sharing avian influenza data, GISAID)下载参考序列,利用Blasts、Mega 6.1及Clustal X 2.1等软件进行序列分析。结果 2014-2018年中国共发生23例人感染H5N6禽流感病毒病例。对19个病例的H5N6病毒的HA和NA基因进行进化分析。HA进化分析显示病毒都属于Clade 2.3.4.4,其中涉及17个病例的病毒属于Group C;首例H5N6病例毒株(A/Sichuan/26221/2014)属于Group D;福建一个病例(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)属于Group B。所有19个病例的病毒HA蛋...

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【部分图文】：

图12014-2018年19例人感染H5N6病毒HA基因进化树

Lee等[3,13]研究发现,从2012年末开始,2.3.4.4H5Nx病毒的HA基因分化出4个不同进化群:GroupA(Buan-like)、B(Gochang-like)、C和D。本研究中,HA进化分析显示(图1),31株病毒都属于Clade2.3.4.4,其中涉及17....

图22014-2018年19例人感染H5N6病毒NA基因进化树

从NA进化树分析可见,H5N6病毒的NA起源于中国家禽中流行LPAIH6N6病毒,进化上为两大分支:A分支属于早期H5N6病毒,NA蛋白茎区没有发生缺失;B分支NA蛋白茎区出现11个氨基酸的缺失。见图2。2.4分子特征分析

本文编号：3943548