奶牛产奶性状候选基因EEF1D和PDE9A功能验证

发布时间：2023-12-10 14:21

　　课题组前期开展的中国荷斯坦牛产奶性状全基因组关联分析利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)两种统计分析方法同时检测到38个显著SNP位点。本研究旨在基于该GWAS结果进一步筛选和鉴定奶牛产奶性状关键基因并进行功能验证。 (1)位置候选基因鉴定及功能注释：基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行了上述38个显著SNPs的位置候选基因筛查和功能预测,最终鉴定到24个位置候选基因并确定了其物理位置、基因类型及功能注释；基于此,进一步从该24个位置候选基因中挑选了10个基因,利用实时荧光定量RT-PCR技术进行了组织表达谱分析,结果发现EEF1D和PDE9A基因在泌乳期中国荷斯坦牛乳腺组织中的mRNA表达量均明显高于其他7个组织(心肌,子宫,肾,肝,肺,卵巢和小肠)。结合前期GWAS结果,初步说明这2个基因与奶牛泌乳功能相关,将之确定为奶牛产奶性状候选基因,进行细胞水平功能验证。 (2)EEF1D和PDE9A基因可变剪接鉴定：通过NCBI和UCSC数据库检索发现EEF1D和PDE9A基因的mRNA序列不完整并且多次改变,同时人和小鼠EEF1D和...

【文章页数】：109 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1.1 奶牛分子育种的主要技术和研究方向
    1.2 可变剪接
    1.3 乳腺上皮细胞的体外培养
    1.4 基因功能验证
    1.5 本研究的目的和主要内容
第二章 基于GWAS确定产奶性状的候选基因
    2.1 试验材料
    2.2 实验方法
    2.3 结果与分析
    2.4 讨论与结论
第三章 EEF1D和PDE9A基因的可变剪接研究
    3.1 试验材料
    3.2 试验方法
    3.3 结果与分析
    3.4 讨论与结论
第四章 牛乳腺上皮原代细胞的分离与培养
    4.1 试验材料
    4.2 试验方法
    4.3 结果与分析
    4.4 讨论与结论
第五章 候选基因过表达和干扰载体的构建
    5.1 材料与方法
    5.2 结果与分析
    5.3 讨论与结论
第六章 总结和后续实验计划
    6.1 现有研究结果
    6.2 后续实验计划
参考文献
致谢
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本文编号：3872574