神经系统特异性转录因子基因NHLH2的5'UTR遗传变异与郏县红牛生长性状的相关分析

发布时间：2024-03-02 06:38

　　神经系统特异性转录因子NHLH2 (nescient helix-loop-helix 2)不仅调控脂肪组织中神经纤维的数量,而且对维持动物能量平衡具有重要作用。寻找与生长性状相关的DNA标记,可为肉牛(Bos taurus)遗传资源的保护、开发与利用提供科学依据。本研究利用PCR-单链构象多态性分析(PCR-single strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)、DNA序列分析和生物信息学技术,探究郏县红牛(B. taurus)NHLH2基因5’UTR的遗传变异与其生长性状的相关性。结果显示,郏县红牛NHLH2基因5’UTR存在2个SNPs,即25G>C和179G>A,形成A和B 2个等位基因,等位基因频率分别为0.239和0.761;检测出AA、BB和AB 3种基因型,BB基因型为优势基因型。相关性分析表明,该基因3种不同基因型对郏县红牛的体重、体长和胸围有显著影响(P<0.05),且BB型个体的体重、体长和胸围均显著大于AA型(P<0.05)。上述实验结果证实,NHLH2基因5’UTR遗传突变与郏县红牛的生长性...

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【部分图文】：

图1NHLH2基因5"UTR的PCR扩增

对2个SNPs进行连锁不平衡分析，结果显示，连锁不平衡参数r2=1，说明2个SNPs呈现完全连锁状态。对郏县红牛NHLH2基因5"UTR的SNP位点进行群体遗传结构分析，结果如表1所示，B等位基因频率大于A,B为优势等位基因，BB基因型为优势基因型；χ2检验值为0.904，表明N....

图2NHLH2基因5"UTR的PCR-SSCP检测

利用SPSS19.0软件，运用最小二乘法，对多态位点的不同基因型与郏县红牛生长性状进行相关性分析。结果显示，郏县红牛胸围、体长和体重的生长性状指标在3种基因型AA、AB、BB间有显著差异性(P<0.05)，由此推测基因型与生长性状之间具有相关性；上述3项指标在BB型个体中的数值....

图3NHLH2基因5"UTR不同基因型的测序峰图

图2NHLH2基因5"UTR的PCR-SSCP检测3讨论

图4不同物种NHLH2氨基酸序列比对

Good等(2008)对GenBank数据库提供的800多人的NHLH2基因序列进行分析，在编码区均未发现多态性。李枫梅(2017)对肉牛bHLH转录因子家族进行鉴定、分类与进化功能分析的结果表明，该家族氨基酸序列呈高度保守状态。本研究对NHLH2进行同源进化分析的结果显示，....

本文编号：3916478