基于蛋白质组学和代谢组学的鹿茸区段划分与生物活性物质的分析与鉴别

发布时间：2024-03-12 22:46

　　鹿茸是一种可以完全再生的骨组织模型,鹿茸从尖部到基部不同区段对应不同的骨发育阶段,其尖部是生长中心,内含间充质细胞层,向下增殖并分化成前软骨层、过渡层、软骨层,再经软骨内骨化成骨。此外,鹿茸在中国被誉为动物药之首,能治疗多种疾病,分析鹿茸不同区段成分的差异是研究其药效的基础和根本。本论文以梅花鹿鹿茸为研究对象,采集新鲜的标准三杈茸,结合我国农业行业标准(NY/T1162-2006)的感官指标和吉林省鹿茸工程研究中心所设立的鹿茸数据化分区值将其分为四个区段,即蜡片、粉片、蜂片和骨片区段。我们知道鹿茸不同区段不仅仅是价格迥异、治疗对象和效果也有很大的不同,而后者是由所含活性物质的种类和含量决定的。本论文采用Label-free定量蛋白质组和非靶代谢组学方法分别对不同区段的蛋白质和代谢物进行鉴定和定量,并用生物信息学分析结果。主要内容和结果如下:1、提取和酶解各区段的总蛋白质,将酶解产物进行质谱鉴定与定量,然后进行PCA模型分析和其他生物信息学分析。结果显示:在蜡片、粉片、蜂片和骨片区段分别鉴定到2039个、1790个、1454个和1358个蛋白;PCA模型分析可看出鹿茸四个不同区段的蛋白质...

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【部分图文】：

图2-1肽段离子得分分布图

中国农业科学院硕士学位论文第二章鹿茸四个不同区段的蛋白质组学82.2结果与分析2.2.1鉴定与定量结果评估2.2.1.1肽段鉴定与定量结果本试验从QExactive高分辨率质谱仪获得高质量的MS1和MS2图谱，然后使用Andromeda（COXetal.2014）分析工具对MS图....

图2-2肽段序列长度分布图

中国农业科学院硕士学位论文第二章鹿茸四个不同区段的蛋白质组学82.2结果与分析2.2.1鉴定与定量结果评估2.2.1.1肽段鉴定与定量结果本试验从QExactive高分辨率质谱仪获得高质量的MS1和MS2图谱，然后使用Andromeda（COXetal.2014）分析工具对MS图....

图2-3鹿茸四个不同区段鉴定到的蛋白质Venn图

中国农业科学院硕士学位论文第二章鹿茸四个不同区段的蛋白质组学92.2.1.2蛋白质鉴定和定量结果对每组样品鉴定到的蛋白数进行统计，结果如表2-1，共鉴定出14873个肽段，利用自建转录组数据库鉴定到2890个蛋白质，通过对蛋白鉴定数据的Venn分析发现四个区段特有蛋白分别为：蜡片....

图2-4鹿茸四个不同区段的PCA得分图

中国农业科学院硕士学位论文第二章鹿茸四个不同区段的蛋白质组学102.2.2鹿茸四个区段的PCA结果PCA是一种无监督的判别分析方法，用来考察组内聚集效果和组间分离趋势是否明显。通过PCA模型分析，第一主成分PC1（84.2%）和第二主成分PC2（8.6%）的分值如图2-4，鹿茸四....

本文编号：3926892