鸡腺病毒HZBL-S1株Hexon蛋白基因序列测定与遗传进化分析

发布时间：2024-04-19 02:18

　　为了解广东省禽腺病毒(Fowl adenovirus,FAdV) HZBL-S1株遗传进化情况,试验对HZBL-S1株六邻体(Hexon)蛋白全基因进行PCR扩增、克隆和序列测定,并对其进行蛋白全基因序列及其氨基酸推导序列的遗传进化分析。结果表明:HZBL-S1株与来自国内外的FAdV基因C型、血清型为4型的参考株的相似性较高,核苷酸(推导的氨基酸)序列的相似性为98.2%～99.9%(98.5%～99.9%)。对Hexon蛋白全基因核苷酸序列及其氨基酸推导序列进行遗传进化分析,HZBL-S1株与基因型为A、B、D、E型的参考株均处于进化树的不同分支,遗传距离相对较远;而与基因型为C型、血清型为4型的参考株均处于进化树的同一分支,遗传距离相对较近。说明HZBL-S1株与基因型为C型的参考株来自同一祖先,推测该病原有可能由国外经某种途径传入我国。

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【部分图文】：

图3HZBL-S1毒株Hexon蛋白全基因

由图3可知:HZBL-S1毒株与A、B、D、E基因型参考毒株均分布在不同分支上,遗传距离相对较远;而与C基因型的参考毒株均分布在同一分支上,遗传距离相对较近。与HZBL-S1毒株遗传距离最近的为China-C毒株,其次为Russia-C、Korea-C毒株。且从血清型上看,Ch....

图4HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸推导序列与参考毒株相似性比较结果

3.4基于Hexon蛋白全基因推导的氨基酸序列相似性比较及进化关系研究HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸推导序列与参考毒株相似性比较结果见图4。由图4可知:HZBL-S1毒株与A、B、D、E基因型参考毒株的同源性都比较低;而与C基因型的参考毒株的同源性很高,为98.5%～....

图5HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸

HZBL-S1毒株与参考毒株Hexon蛋白氨基酸推导序列的遗传进化分析结果见图5。由图5可知:HZBL-S1毒株与A、B、D、E基因型参考毒株均分布在不同分支上,遗传距离相对较远;而与基因型为C型的China-C、Russia-C和Korea-C毒株均分布在同一小分支上,遗传距....

图1Hexon蛋白全基因PCR扩增产物电泳结果

PCR扩增结果表明,扩增的Hexon蛋白基因条带大小与预期结果一致,约为2811bp,见图1。3.2基因克隆菌液的鉴定

本文编号：3958083