陕西省羊矛形岐腔吸虫的种群遗传结构研究

发布时间：2024-06-11 19:08

　　矛形歧腔吸虫是一种非常常见的寄生虫，主要寄生于山羊、绵羊、牛、骆驼等反刍动物的胆囊和肝脏中，给畜牧业生产造成严重的损失。本研究对陕西省不同地区矛形歧腔吸虫的核糖体(rDNA)内转录间隔区(ITS)、基因间隔区(IGS)和线粒体三段基因(pcox1、pnad1和pcytb)进行了扩增、测定和分析。基于这些基因片段，应用分子生物学软件对矛形歧腔吸虫进行系统发育分析，探讨矛形歧腔吸虫遗传变异和种群遗传结构。结果如下： 1.扩增了陕西省不同地区25个矛形歧腔吸虫的ITS rDNA基因，并对其进行了序列分析。矛形歧腔吸虫ITS rDNA总长度为1144bp，其中ITS1、5.8S和ITS2rDNA的长度分别为749bp、161bp和234bp。遗传变异研究表明，ITS1和ITS2的种内差异分别为0⁰.5%和0¹.3%。由于矛形歧腔吸虫的近缘种未有已发表的ITS1序列，且5.8S的序列非常保守，因此只对矛形歧腔吸虫ITS2的种间变异进行了研究，差异为3.4%¹2.3%。基于ITS2基因构建的进化树可将矛形歧腔吸虫与歧腔科其他吸虫区分...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-2基于ITS2rDNA序列，以NJ法构建的歧腔吸虫的种系发育关系

2.2.3种群遗传结构研究为了进一步研究陕西省矛形歧腔吸虫的种群遗传结构，基于ITS2rDNA基因，用NJ法对歧腔吸虫进行遗传进化分析（图2-2）。本研究中的所有样本与参考文献中的绵羊和山羊矛形歧腔吸虫在同一枝上，牛和日本鬣羚矛形歧腔吸虫聚集在同一枝上。来自不同地区或....

图3-1矛形歧腔吸虫IGSrDNA序列片段的PCR扩增结果

5000；1.SJ6；2.SSL4；3.SY3；4.SZ4；5.GM3；DL5000;1.SJ6;2.SSL4;3.SY3;4.SZ4;5.GM3;6.G3-1矛形歧腔吸虫IGSrDNA序列片段的PCR扩增Fig.3-1IG....

图3-4基于IGSrDNA序列，以NJ法构建的歧腔吸虫的种系发育关系

图3-4基于IGSrDNA序列，以NJ法构建的歧腔吸虫的种系发育关系ylogeneticrelationshipsofDicrocoeliumspeciesinferredbyneighbour–joining(NJ)mbasedonthe....

图4-4基于合并的cox1+nad1+cytb基因序列以最大简约法所构建的自展一致树

Note:NumbersatnodesindicatebootstrapvaluesresultiongfromposteriorprobabilityvaluesfromBI/MP/ML,andvalueslowerthan50aregi....

本文编号：3992577