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寄养金华仔猪肠道微生物的宏基因组研究

发布时间:2024-12-21 01:50
  肠道微生物发挥着能量代谢调控、异源物质代谢、细胞修复、免疫等重要作用,与宿主的健康与疾病有着直接关系。肠道微生物菌群的建立受到出生方式、抗生素、疾病、饮食、周围环境和基因型等多种因素的影响,猪也不例外。寄养是工厂化养猪生产中常见的手段,可以达到均衡母猪带仔数、降低哺乳期死亡率、提高断奶重的目的。然而,寄养对仔猪肠道微生物的影响目前尚不清楚。本研究中将金华仔猪出生后立即寄养给了约克母猪,另有非寄养的金华仔猪、约克仔猪及采食开食料的约克仔猪作为对照组。所有仔猪21日龄时屠宰。屠宰前,称空腹重。屠宰后,立即收集它们的盲肠内容物。提取盲肠内容物总微生物DNA后,选择16S rDNA V3区进行扩增,再用Illumina HiSeq2000进行宏基因组测序。所得数据用主要用QIIME和Mothur等软件进行数据预处理和下游分析。通过分析,得到了仔猪微生物菌群alpha多样性、beta多样性等相关数据。最后,通过LEfSe分析去鉴定差异OTU。实验结果显示:金华仔猪寄养后,生长速度显著高于它们的同胞兄弟。宏基因组测序的数据,经数据处理后得到了2,300,922个高质量的16S rDNA reads,...

【文章页数】:115 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

图1-1微生物调节宿主代谢功能??Figure1-1?Microbiota?regulates?host?metabolic?functions.??

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图1-1微生物调节宿主代谢功能??Figure1-1?Microbiota?regulates?host?metabolic?functions.??弓?I?自:Tilg?H.?Kaser?A.?Gut?microbiome,?obesity,?and?metabolic?dys....


图2-1各沮仔猪的平均日增重??巧2-1.?Averae?ailrowt?rates.??

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??实验仔猪哺乳期生长指标见表2-2和图2-1。其中平均日增重=(断奶重-初??生重)/21。??表2-2仔猪哺乳期生长指标??Table?2-2.Sample?information?and?growth?rate?of?t:he?piglets?during?化e?21?da....


图2-2背最长肌肌纤维切片图(横切)??(a)JJ组;(b)YJ组;(c)YYl组;(d)YY2组;??Fi.?2-2?Paraffin?cro巧-sections?of?成?竹/?muscle?from?theiletsaJJrou;?b?YJrou;??

图2-2背最长肌肌纤维切片图(横切)??(a)JJ组;(b)YJ组;(c)YYl组;(d)YY2组;??Fi.?2-2?Paraffin?cro巧-sections?of?成?竹/?muscle?from?theiletsaJJrou;?b?YJrou;??

??由表2-2和图2-1可W看出,YY1、YY2组仔猪平均日增重都极显著高于JJ组。??YJ组仔猪平均日增重也极显著离于JJ组,但还没有达到YY1或YY2组的水平。??YY1、YY2组间平均日増重差异不显著。??4.?2石蜡切片(H&E染色)??H&E染色后肌纤维组织学结构清晰可....


图2-3各姐间肌纤维平均直径??Fig.?2-2?Mean?dimeter?of?i.成?rsz?muscle?of?比e?pi呂lets??

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图2-3各姐间肌纤维平均直径??Fig.?2-2?Mean?dimeter?of?i.成?rsz?muscle?of?比e?pi呂lets??如图2-3所示,各组肌纤维直径分别是:JJ组20.271±2.295nm;?YJ组??18.703±3.411?畔1,YY1?组?16.4....



本文编号:4018203

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