不同体况对妊娠初期母牛阴道菌群的影响

发布时间：2024-12-31 23:21

　　 为研究不同体况对妊娠初期母牛阴道菌群的影响,采集相同放牧条件下不同体况妊娠初期西门塔尔母牛18头(每组6头,偏瘦组（TC）,标准组（MC）和肥胖组（FC）)阴道分泌物,利用16SrRNA测序技术对其阴道菌群多样性进行分析。结果显示:18份样品平均每份样品测得70 567条序列,经过质控平均得到68 309条序列,质控有效率达96.84%;通过聚类共获得2 677个操作分类单元（Operational taxonomic units,OTU）,37.58%的OTU注释到门水平,24.36%的OTU注释到属水平;标准组阴道菌群Alpha多样性指数的Shannon指数、Chao1指数和ACE指数均显著低于肥胖组和偏瘦组（P<0.05）;各组阴道菌群的Good’s coverage指数均在99.4%以上,表明样本测序质量较高;在门水平上,偏瘦组、标准组和肥胖组妊娠初期母牛阴道中前10大优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、变形菌门（Proteobacteria）、无壁菌门（Tenericutes）、放线菌门（Actinobacteria）、梭...

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【部分图文】：

图1 18份样品的稀释曲线

表1显示了不同体况阴道菌群Alpha多样性指数，直接反映微生物群落的丰度及多样性。Shannon值越大，生物多样性越高；Simpson值越低，表明生物多样性越高；Chao1指数和ACE指数是估计物种总数的常用指数，值越大，生物多样性越高。Good’scoverage表示样本的测....

图2 各组样品基于Weighted Unifrac距离PCoA分析

β多样性分析是对不同样本的微生物群落构成进行比较分析。主坐标分析反映了各样本中菌群构成的相似性。基于WeightedUnifrac距离进行PCoA分析（图2），并选取贡献率最大的主坐标组合进行作图展示。如果样本距离越接近，表示物种组成结构越相似，因此群落结构相似度高的样本倾向于....

本文编号：4021694