利用转录组测序筛选与鸭青壳性状形成相关的基因

发布时间：2017-06-16 05:03

  本文关键词：利用转录组测序筛选与鸭青壳性状形成相关的基因，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：青壳性状是鸭(Anas platyrhynchos domesticus)重要的经济性状,但其遗传机制尚未揭晓。为研究鸭青壳性状形成的转录组基础,本研究通过测交法选育出基因型为纯合青壳以及纯合白壳绍兴鸭,并对两种基因型个体子宫组织进行转录组测序。本研究共获得288 008 582个高质量数据,组装出64 587个转录本,其中包括19 589个新转录本。鉴定20 302次可变剪切事件,其中外显子跳跃是最主要的可变剪切类型。表达分析发现1 768个基因在两种基因型个体间差异表达,其中包括与蛋壳主要色素物质(原卟啉、胆绿素及其螯合物)相关的基因,例如胆绿素还原酶A基因(biliverdin reductase A,BLVRA)、尿卟啉原Ⅲ合酶基因(uroporphyrinogenⅢsynthase,UROS)、血红蛋白α亚基基因(hemoglobin subunit alpha-1,HBA1)以及血红素绑定蛋白1基因(heme binding protein 1,HEBP1)等。差异基因的基因本体(Gene Ontology,GO)注释以及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析表明这些基因涉及广泛的生物功能及通路,其中与蛋壳颜色形成密切相关的有血红素代谢功能(例如,血红素绑定以及四吡咯绑定)及胆汁代谢通路(例如,胆汁酸合成通路,胆汁分泌通路)。本研究首次探索了鸭蛋壳颜色形成的转录组基础,获得了一批差异表达基因,这些基因为进一步研究鸭蛋壳颜色形成的遗传机制提供了有价值的信息。
【作者单位】： 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所;
【关键词】： 青壳 差异表达基因 血红素 胆汁
【基金】：国家自然科学基金项目(No.31402065) “十二五”国家科技支撑计划项目(No.2012BAD39B00) 国家水禽产业技术体系专项(CARS-43-2)
【分类号】：S834
【正文快照】： 禽类的蛋壳根据其颜色主要分为褐壳、青壳、白壳三种,其中褐壳和白壳是两种主要的蛋壳颜色。蛋壳颜色是衡量蛋品质量的指标之一,与其他两种颜色相比目前普遍认为青壳蛋蛋壳较厚,蛋壳强度较大,抗太阳辐射、氧化以及破损能力较强(袁青妍,卢立志,2007),有利于增加蛋的储藏时间以

【相似文献】

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 赵永贞;陈秀荔;李咏梅;黎铭;陈晓汉;;抑制性消减杂交技术在对虾基因克隆中的应用[A];2007年中国水产学会学术年会暨水产微生态调控技术论坛论文摘要汇编[C];2007年

  本文关键词：利用转录组测序筛选与鸭青壳性状形成相关的基因，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：454440