畜禽长链非编码RNA的功能及其研究方法

发布时间：2017-07-02 04:00

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【摘要】：长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,不具有编码蛋白质的能力,主要参与脂肪代谢、肌肉发育、胚胎发育、性别决定与分化等多种生物过程和疾病的调控。在LncRNA研究中,研究方法的建立和应用起着至关重要的作用。作者简述了LncRNA的生物学特性和生物学功能,重点介绍了LncRNA的主要研究方法:基因芯片、RNA-seq、Northern blotting、荧光原位杂交(FISH)、实时荧光定量PCR、RNA结构平行分析(PARS)、快速预测RNA和蛋白质相互作用(CatRAPID)等,同时介绍了LncRNA与DNA、RNA及蛋白质的相互作用的方法:RNA-pulldown、RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)、光活性增强的核糖核苷交联和免疫共沉淀(PAR-CLIP)、RNA反义纯化(RAP)、RNA纯化的染色质分离(CHIRP)及RNA靶标的捕获杂交分析(CHART)、交联,连接以及混合测序(CLASH),为畜禽动物中LncRNA的研究提供借鉴。
【作者单位】： 华中农业大学动物医学院国家兽药残留基准实验室(HZAU)农业部畜禽产品质量安全风险评估实验室(武汉)农业部兽药残留检测重点开放实验室;
【关键词】： 长链非编码RNA 畜禽 生物学功能 研究方法
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划:2011AA10A214)
【分类号】：S852.2
【正文快照】： 基因组计划研究表明,在组成人类基因组的30亿个碱基对中,约有93%的基因序列可以被转录,但是不具有编码蛋白质能力的非编码RNA占转录组的98%[1]。这些序列曾被认为是进化过程中累积的“垃圾序列”,是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,不具有生物学功能,因而没有给予足够的重视。随着测

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本文编号：508412