先天性巨结肠差异IncRNA-mRNA共表达谱芯片初步筛查研究
本文关键词：先天性巨结肠差异IncRNA-mRNA共表达谱芯片初步筛查研究
【摘要】：目的:通过芯片筛查出先天性巨结肠病变段肠管与正常段肠管中差异lnc RNA-m RNA共表达谱,并对其进行功能分析,探索lnc RNA在HD中的作用及其作用机制,为HD早期诊断、早期治疗提供实验依据。方法:收集2013年10月到2015年9月期间在遵义医学院附属医院小儿普胸泌外科确诊为先天性巨结肠并进行手术治疗的17例患儿标本(病变段及正常段肠管);选取其中5例患者的标本(共10段肠管)进行人类lnc RNA-m RNA共表达谱芯片筛查,同时采用Agilent Gene Spring软件对差异表达的lnc RNA、m RNA进行筛选。对筛查出差异表达明显的lnc RNA进行实时荧光定量PCR(q RT-PCR)验证;采用生物信息学的方法分析lnc RNA、m RNA在先天性巨结肠的作用。结果:芯片结果显示在先天性巨结肠病变段肠管中有353个表达明显上调的lnc RNA,有474个明显下调的lnc RNA(选择标准为差异倍数2,P0.05)。m RNA的表达中有865个明显上调,461个明显下调(选择标准为差异倍数2,P0.05)。对其中6个显著差异表达的lnc RNA(TCONS_00029197、ENST00000438136.1ENST00000445908.1、ENST00000455286.1、ENST00000579378.1和TCONS_00028253)进行q RT-PCR验证?其中TCONS_00029197、ENST00000445908.1、ENST00000455286.1在先天性巨结肠中表达显著上调,而ENST00000579378.1表达显著下调,P0.05,与芯片结果相符。ENST00000438136.1虽然在先天性巨结肠中存在表达上调,但其差异表达不显著,P0.05,无统计学意义。其中TCONS_00028253由于引物经多次设计未成功,未进行差异表达分析。生物信息学分析结果显示差异基因与细胞迁移、定植、轴突生长、细胞-基底粘附、酶活性等功能相关。结论:先天性巨结肠患儿病变段肠管和其正常段肠管中存在较多差异表达的lnc RNA和m RNA。lnc RNA和m RNA之间具有广泛的联系,形成共表达网络,lnc RNA可能是通过调控对应m RNA影响细胞增殖、分化等来参与HD的发病。
【学位授予单位】：遵义医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R726.5
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