基于转录组测序技术的重症手足口病差异表达基因研究

发布时间：2017-12-26 03:36

  本文关键词：基于转录组测序技术的重症手足口病差异表达基因研究　出处：《南华大学》2016年硕士论文　论文类型：学位论文

  更多相关文章： 转录组测序 重症手足口病 差异表达基因 实时荧光定量PCR 酶联免疫吸附测定法

【摘要】：目的:应用转录组测序技术(RNA-sequencing,RNA-seq)分析重症手足口病(sever hand,foot and mouth disease,SHFMD)患儿外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)转录组情况,筛选SHFMD显著差异表达基因(differently express genes,DEGs),为SHFMD的早期识别、及时治疗提供理论依据,为减少疾病死亡率、改善疾病愈后提供帮助。方法:收集2014年5月-2014年8月深圳市第三人民医院收治的重症和普通型手足口病(mild hand,foot and mouth disease,MHFMD)患儿各5例,以及5例健康体检儿童的外周静脉血5ml,分离PBMC并提取总RNA,采用RNA-seq技术筛选DEGs,并通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)及酶联免疫吸附测定法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)从转录组和蛋白组水平分别对RNA-seq筛选所得DEGs结果进行再次检测。结果:RNA-seq分析示SHFMD相对健康对照组(healthy control,HC组)共117个DEGs,其中108个基因上调,9个基因下调;SHFMD相对MHFMD组共26个DEGs,其中14个基因上调,12个基因下调;两组DEGs中共有8个相同表达基因,其中S100A8、S100A12、IL-8和IL-1β表达上调,TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA表达下调。进一步qRT-PCR及ELISA检测结果均与RNA-seq结果一致(P0.05)。结论:1.RNA-seq技术初步建立了HFMD差异基因表达谱。2.表达上调的S100A8、S100A12、IL-8、IL-1β和表达下调的TNFRSF13C、IL-7R、THBS1、VEGFA是SHFMD差异表达基因,有望成为HFMD重症化的预测指标。
【学位授予单位】：南华大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R725.1

【参考文献】

相关期刊论文 前8条

1 李明;孔小平;刘宏;程灵犀;黄京璐;权力;午方宇;郝博;刘超;罗斌;;婴幼儿脑干脑炎EV71-VP1、PSGL-1和SCARB2的表达[J];法医学杂志;2015年02期

2 冯慧芬;段广才;朱光;;重症手足口病患儿血清炎性细胞因子动态变化与神经源性肺水肿的关系[J];中华实用儿科临床杂志;2015年06期

3 李佩青;李薇;黄宇戈;马力忠;吴林;杨思达;;肠道病毒71型感染重症54例症状体征及其出现时间对死亡的预警[J];中国循证儿科杂志;2014年05期

4 张会平;王丽;钱继红;蔡康;陈颖虹;张庆立;俞慧菊;;利巴韦林气雾剂治疗小儿手足口病的有效性和安全性研究[J];中国当代儿科杂志;2014年03期

5 曹瑞源;韩剑峰;秦鄂德;秦成峰;;重症手足口病免疫球蛋白治疗的机理探讨[J];生物工程学报;2011年05期

6 陈永平;;重症手足口病的早期识别与处理[J];医学与哲学(临床决策论坛版);2010年09期

7 陶建平;杨思达;邓力;赖剑蒲;徐翼;龚四堂;;重症手足口病的诊断与治疗[J];中国实用儿科杂志;2009年06期

8 陈云飞;单南冰;张祝娟;张怀伟;吕勇;陆国平;;重症手足口病患儿的氧疗和气道管理[J];中国危重病急救医学;2008年08期

，

本文编号：1335655