肺炎患儿肺炎支原体的分子检测和基因分型及耐药机制的研究
发布时间:2018-05-31 19:23
本文选题:肺炎支原体 + 聚合酶链反应 ; 参考:《天津医科大学》2013年硕士论文
【摘要】:目的: 通过对住院肺炎患儿的肺泡灌洗液(BALF)和静脉血标本进行检测分析,了解肺炎患儿中肺炎支原体(MP)的感染情况、流行病学特征及其基因分型特点,探讨出儿童MP早期感染的快速诊断方法。同时了解本地区住院MP肺炎患儿耐大环内酯类抗菌药物情况及主要的耐药机制,为以后临床选择合理的抗生素提供理论依据。 方法: 1.收集天津市儿童医院2010年10月至2011年11月确诊为肺炎的住院患儿BALF标本220份,同时在入院当天或次日清晨收集其静脉血通过酶联免疫吸附试验(ELISA法)检测MP的IgM抗体;对220份BALF标本,提取DNA,采用聚合酶链反应(PCR)对其进行MP病原检测,并随机抽取75份标本进行荧光定量PCR检测验证其结果的准确性。 2.随机抽取部分阳性BALF标本用HaeⅡ和HaeⅢ两种限制性内切酶进行酶切反应,并用标准株M129作比,对其阳性标本作出基因分型。同时随机选取几份阳性标本的扩增产物进行测序证实上述分型研究的准确性。 3.从检测阳性的BALF标本中按每月随机抽取3-5份共50份进行巢式PCR反应,电泳,在紫外灯下切胶纯化回收产物并送去测序,测序结果与NCBI已登录的MP标准株M12923SrRNA基因(序列号为X68422)作对比,观察其有无耐药基因位点的突变。 结果: 1.220例住院肺炎患儿血清学MP-IgM抗体检测中,有92例阳性,阳性率为41.8%(92/220);BALF的PCR检测中,阳性标本121份,阳性率为55%(121/220);其中女性患儿阳性率61.22%(60/98),男性50%(61/122),经统计学分析,两者无明显统计学差异(χ2=2.77,P0.05);学龄前期和学龄期儿童的阳性率为63.52%(101/159),明显高于婴幼儿(32.79%),经统计学分析,两者有明显的统计学差异(χ2=16.827,P0.05甚至0.005);春秋季的阳性率高于冬夏季节,但经统计学分析,这四季间阳性率无明显统计学差异(χ2=2.28,P0.05)。 2.随机挑选的75份标本进行了荧光定量PCR检测,其中阳性结果44份,阳性率为58.67%(44/75)。通过分析发现,这75份标本用血清学检测阳性结果30份,阳性率为40%(30/57);普通PCR检测阳性结果39份,阳性率为52%(39/75),血清学检测的阳性率低于普通PCR和荧光定量PCR,经统计学分析,这两者均具有明显的统计学差异(χ2=4.76,P0.05和χ2=7.68,P0.05);普通PCR的阳性率低于荧光定量PCR,但经统计学分析,两者无明显的统计学差异(χ2=1.78,P0.05)。 3.随机抽取的60份阳性标本经过酶切反应后酶切图谱与标准株M129完全一致,均显示为P1-Ⅰ型,3份测序结果也证实其为P1-Ⅰ型。未发现不同的型别情况。 4.50份测序结果显示,其中4份和标准株的测序结果与NCBI已登录的MP标准株M12923SrRNA基因序列一致,其余46份均出现2063位A→G突变,未见其他位点的突变,耐药率为92%(46/50)。 结论: 1.MP是住院肺炎患儿的重要病原,无明显的性别差异和季节差异,但有较明显的年龄特征,好发于学龄前期儿童和学龄期儿童。 2.普通PCR检测MP特异性强、灵敏度高、快速简便、成本低,可作为MP早期快速诊断的检测手段。 3.天津地区MP流行株以P1-Ⅰ型为主。 4.天津地区MP耐大环内酯类药物现状严重,其主要的耐药机制为23SrRNA V区产生A2063G点突变。
[Abstract]:Purpose :
The infection status , epidemiological characteristics and genotyping characteristics of mycoplasma pneumoniae ( MP ) in children with pneumonia were analyzed by detecting the pulmonary alveolar lavage fluid ( BALF ) and venous blood samples in hospitalized children with pneumonia .
Method :
1 . We collected 220 hospitalized children with pneumonia diagnosed as pneumonia in Tianjin Children ' s Hospital from October 2010 to November 2011 , and collected the IgM antibody of MP by enzyme linked immunosorbent assay ( ELISA ) at the same time on the day of admission or early morning .
For 220 BALF samples , DNA was extracted , MP pathogen detection was carried out by polymerase chain reaction ( PCR ) , and 75 samples were randomly sampled for fluorescence quantitative PCR to verify the accuracy of the results .
2 . The positive BALF samples were digested with Hae II and Hae 鈪,
本文编号:1960996
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