IL-15基因单核苷酸多态性与儿童急性淋巴细胞白血病的相关性研究

发布时间：2018-06-27 10:00

  本文选题：白细胞介素-15 + 儿童急性淋巴细胞白血病　； 参考：《重庆医科大学》2012年硕士论文

【摘要】：目的：急性淋巴细胞白血病（ALL）是儿童时期最常见的恶性肿瘤，儿童ALL的化疗以基于不同危险因素的个体化治疗为主，虽然已经识别出多个与儿童ALL预后不良相关的危险因素，但这些危险因素造成预后不良的机制不完全清楚。IL-15是与免疫细胞增殖、分化以及凋亡密切相关的细胞因子。近来的研究显示IL-15与ALL的发病及预后有关，其中发现IL-15基因单个核苷酸多态性位点（SNP），即rs17007695、rs35964658、rs10519613、rs10519612、rs17015014与儿童ALL微小残留病密切相关，同时发现rs17007695和rs10519612与中国成人急淋的发病易感性有关。 高分辨率熔解曲线分析是近年来受到关注的一种高通量、准确、廉价的基因分型技术，其中非标记探针法尤其适用于对已知SNPs位点进行基因分型。本研究通过建立用于检测IL-15基因SNP位点的HRM-非标记探针的方法，对IL-15基因4个SNPs位点（rs17007695、rs35964658、rs10519613、rs17015014）进行基因分型，并在此基础上探讨IL-15基因单核苷酸多态性与中国儿童ALL发病易感性以及与儿童ALL预后不良危险因素的关系。 方法：病例组为173例入组CCLG-2008治疗方案的ALL患儿，正常对照组为222例健康体检的儿童。采用高分辨率熔解曲线-非标记探针法对rs17007695、rs35964658、rs10519613、rs17015014共四个SNPs进行基因分型。运用SHEsis在线软件及SPSS17.0统计软件进行各组间基因型分布差异分析及OR值计算。 结果： 1.非标记探针法与基因测序分型结果一致，，能够对本研究所涉及的4个位点进行准确分型。另一方面，在未加入高低温内标的的情况下，小片段扩增法不能区分野生纯合子和突变纯和子。 2.rs17007695、rs35964658、rs10519613和rs17015014的等位基因和基因型分布在ALL组和对照组间无差异。rs17015014C等位基因在B-ALL患儿和对照组间有差异，C等位基因与B-ALL患病相关（P=0.03,OR1.39,95%CI1.03 1.87），其中CC型增加了B-ALL的患病风险（P=0.03,OR1.89,95%CI1.05-3.41）。 3.对ALL组和对照组进行性别年龄的分层分析后发现，rs17015014-CC型是女性儿童人群发生ALL的危险因素(P=0.04,OR3.06,95%CI1.04-8.99)；经过校正，即去除性别和年龄因素影响后，rs17015014-CC型在ALL组和对照组间的分布差异具有显著性（P=0.04,OR1.88,95%CI1.03 3.48），并且其在B-ALL组和对照组间的差异显著性经校正后仍然存在（P=0.04,OR=1.93,95%CI1.04-3.56）。 4.rs10519613、rs35964658、rs17007695和rs17015014构成5种主要的单倍型（最小单倍型频率3%）：CATG、AGCC、CATC、AGCG和CACC。其中，病例组CACC单倍型频率较对照组高（0.048和0.015，P=0.0057；OR：3.392，95%CI：1.357~8.480）。 5.rs10519613基因型在诱导缓解第15天不同骨髓缓解状态组间的分布具有差异，CC型患儿第15天骨髓缓解状态为M3的分布频率较M1+M2组高（66.7%和28.1%，P=0.035）；单倍型分析显示CATG型在D15-M3组分布频率较在M1+M2组中高(OR2.416,95%CI1.049 5.774,P=0.034)。 6.未发现有与初诊危险度分组相关的基因型或单倍体型；但在经过危险度调整后，单倍型AGTG在中高危组的分布频率较在低危组低（OR0.108,95%CI0.016 0.753,P=0.045）。 结论： 1.rs10519613、rs35964658、rs17007695与儿童ALL的发病风险无相关性，在分层分析中亦未发现上述位点与儿童ALL发病相关。rs17015014-CC型与儿童B-ALL发病相关，携带rs17015014-CC型女性儿童ALL发病风险增加；单倍型CACC与儿童急淋发病易感性相关。 2.携带rs10519613CC型或单倍型CATG的急淋患儿诱导缓解D15骨髓不缓解的发生风险增加。 3.单倍型AGTG在中高危组的分布频率较在低危组低，提示携带该基因型的患儿预后相对较好。 4.高分辨率熔解曲线分析-非标记探针法是对已知SNP位点突变研究的一种廉价、简便、快速准确的基因分型技术。
[Abstract]:Objective : Acute lymphoblastic leukemia ( ALL ) is the most common malignant tumor in childhood . The chemotherapy of ALL is based on individualized treatment based on different risk factors . Although multiple factors related to the prognosis of ALL have been identified , it is not clear that IL - 15 is associated with the pathogenesis and prognosis of ALL . It is found that IL - 15 is closely related to the pathogenesis and prognosis of ALL . It is found that IL - 15 is closely related to the pathogenesis and prognosis of ALL . It is found that rs177695 and rs10519612 are related to susceptibility to acute lymphoblastic leukemia in China .

High - resolution melting curve analysis is a high - throughput , accurate and low - cost genotyping technique in recent years , in which the non - labeled probe method is particularly suitable for genotyping of known SNPs sites .

Methods : In the case group , 173 patients with ALL were enrolled in the treatment regimen , 222 healthy children in the normal control group were genotyped by high - resolution melting curve - non - labeled probe method , and the genotype distribution difference and OR value were calculated by using the SHEsis online software and SPSS 17.0 statistical software .

Results :

1 . The non - labeled probe method is consistent with the results of gene sequencing typing , which can accurately classify the four sites involved in this study . On the other hand , in the absence of high - low - temperature internal standard , the small fragment amplification method cannot distinguish the wild homozygotes and the mutant pure and children .

2.rs17007695,rs35964658,rs10519613鍜宺s17015014鐨勭瓑浣嶅熀鍥犲拰鍩哄洜鍨嬪垎甯冨湪ALL缁勫拰瀵圭収缁勯棿鏃犲樊寮

本文编号：2073544