2006年秋冬季腹泻患儿轮状病毒基因型研究

发布时间：2020-05-28 05:30

【摘要】： 目的研究2006年秋冬季腹泻患儿轮状病毒基因型。 方法收集昆明医学院第一附属医院2006年10月～2006年12月住院的腹泻患儿的粪便标本60份,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)方法检测RV抗原,逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法以及巢式聚合酶链反应(net-PCR)进行VP7和VP4基因分型,从VP7阳性标本中随机挑选出4株重型腹泻和4株轻型腹泻患儿以及4株合并呼吸道感染的患儿的标本通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NSP4基因并进行测序,测序结果应用DNAassist和Clustal-mp以及MEG3.0软件进行序列分析。 结果(1)60份粪便标本中,40份检测到A组轮状病毒RNA基因,阳性率为66.7%;(2)40份阳性标本进行VP7基因分型研究,其中33份扩增出VP7基因全长片断,对阳性标本进行VP7基因分型研究,G3型为18(54.5%),其中G1型3例(9%),G1和G3混合感染型6例(18.1%),G2和G3混合感染5例(15.1%),G1与G9混合感染1例(3.3%),未发现其他型;(3)43份阳性标本40份扩增出VP4基因全长片段,对阳性标本进行VP4基因研究,P8型为31例(77.5%),P6型4例(10%),P8和P6混合感染型1例(2.5%),未分型4例。(4)轮状病毒G型和P型的组合G3P8型为主,占42.4%。(5)33份VP7阳性标本均可以扩增出NSP4的全长片段,在这12株昆明株中有9株与来自GenBank Database的人RV(Wa、KUN、AU-1、Ho-chi)和动物RV(EW、OSU、SA11)同源性分别为90%～94%、80～81%、77%～79%、60%～62%、60.5%～62%、86%～88%、79%～80%,与韩国、斯洛文尼亚以及中国各地区流行株同源性均在90%以上.3株昆明株与以上来GenBankDatabase的标准株和其他地区流行株核苷酸和氨基酸的同源性均低于80%. 结论昆明地区A组Rv以G3P8型为主要流行基因型,混合感染比例较往年有所增加,并出现新的基因型G9型,合并有呼吸道感染的多为G3P8型;12株昆明地区轮状病毒株的NSP4基因9株为Wa型,3株出现变异.
【学位授予单位】：昆明医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2008
【分类号】：R725.1

【参考文献】

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1 方肇寅,齐锦,杨辉,王承训,叶青,马莉,唐景裕,何爱华,杜曾庆,谢健屏,卢亦愚,吴海燕,章菁,林思恩,谢华萍;我国1998～1999年流行的婴幼儿腹泻轮状病毒的分型研究[J];病毒学报;2001年01期

2 李丹地;段招军;章青;刘娜;谢华萍;崔淑贤;靳淼;杨学梅;郑丽舒;黄灿平;匡治州;王忠山;方肇寅;;G5型人A组轮状病毒LL36755株的VP4、VP6和NSP4编码基因的分子特征[J];病毒学报;2007年03期

3 钱渊，袁丽娟，，熊朝晖，张又，刘军，关德华，王之梁;在我国腹泻患儿中发现G9型轮状病毒感染[J];病毒学报;1994年03期

4 张春芳;贾立英;;亚洲地区轮状病毒感染的流行病学概况[J];中国当代儿科杂志;2006年01期

5 徐元敏;田杰;钟家蓉;刘晓燕;钱永如;;轮状病毒肠炎合并病毒性心肌炎临床特点及治疗分析[J];儿科药学杂志;2006年02期

6 张静;轮状病毒的分子流行病学研究进展[J];国外医学(儿科学分册);1999年03期

7 高华英;孟红;;VP7、VP4与轮状病毒装配及分子流行病学[J];国际流行病学传染病学杂志;2006年02期

8 焦富勇 ,康华,王可胜;小儿轮状病毒性腹泻研究进展[J];国外医学.妇幼保健分册;2002年01期

9 曹志亮;陈元鼎;;轮状病毒肠毒素NSP4:一个多功能糖蛋白[J];生物技术通讯;2006年05期

10 李东;国泰;杨晓明;;轮状病毒疫苗的研究现状[J];中国生物制品学杂志;2007年11期

本文编号：2684788