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肠道病毒感染在儿童手足口病及下呼吸道感染疾病中的研究

发布时间:2020-08-25 01:24
【摘要】: 目的分析肠道病毒(EV)在儿童手足口病及下呼吸道感染疾病中的感染状况及血清型特征,并探讨实时PCR方法在临床标本中的诊断价值,为临床诊断和治疗提供参考。 方法1.研究对象2009年4月至9月,首都儿科研究所附属儿童医院感染科门诊诊断的手足口病患儿。采集患儿咽拭子和疱疹液及血清,用实时RT-PCR方法同时检测肠道病毒通用型(EV)、柯萨奇A16型(CA16)、肠道病毒71型(EV71);用ELISA方法对留取的双份血清标本同时检测柯萨奇A16型、肠道病毒71型IgM抗体,结果与实时RT-PCR法结果进行比较分析。选取CA16、EV71阳性标本进行VP1区基因片段扩增,电泳鉴定后测序,与Genbank进行blast比对,并利用生物分析软件进行进化分析。 2.研究对象2008年6月至2009年9月,首都儿科研究所附属儿童医院呼吸病房收治的下呼吸道感染患儿。采集患儿静脉血分离血清,呼吸道标本,ELISA方法检测血清EV IgM,实时RT-PCR方法检测呼吸道标本。与其他下呼吸道感染相关的病原进行比较分析。对RT-PCR阳性标本进行VP4区扩增测序,部分标本进行5‘非编码区的扩增测序,结果与Genbank进行blast比对,确定EV血清型。 结果1.174例手足口病患儿中EV阳性167例, CA16阳性率67.1%(112/167),EV71阳性率27.5%(46/167)。CA16:EV71为2.43:1。131例患儿采集到双份静脉血,第一次血清CA16型IgM抗体阳性38.9%(51/131),二次血清阳性74.8%(98/131):第一次血清EV71型IgM抗体阳性19.1%(25/131),二次血清阳性24.4%(32/131)。第一次血清结果与实时RT-PCR结果进行比对, CA16、EV71一致性检验Kappa值0.353、0.735;二次血清结果与实时RT-PCR结果比对, CA16、EV71一致性检验Kappa值0.830、0.898。实时RT-PCR法结果与二次血清检测IgM结果一致性很好。测序结果:CA16阳性标本病毒株同源性88.7%-98.5%,与13株B基因组参比序列核苷酸同源性88.1%-96.4%。EV71标本病毒株核苷酸同源性95.8%-98%,属C4亚型;与C4亚型参比序列核苷酸同源性96.5%-98.2%;与C4亚型以外的其他基因型及亚型的同源性81.9%-90%。 2.402例下呼吸道感染患儿,血清EV-IgM抗体阳性21.1%(85/402),柯萨奇病毒74例,埃可病毒56例,其中45例患儿血清同时检测到上述两种病毒IgM抗体。2008年6月-2009年9月的15个月均检测到EV-IgM抗体,2008年12月阳性率最低,2008年7月阳性率最高。学龄儿童阳性率相对较高。85例EV阳性患儿中62例伴MP感染,10例伴常见呼吸道病毒感染。呼吸道标本实时RT-PCR法检出EV阳性15例,阳性率3.7%(15/402)。阳性标本测序结果通过blast比对,确定EV血清型包括EV68 3例,ECH030 3例,CVB2 2例,EV71、CVA3、CVA9、CVB1和CVB3各1例。与肺炎相关血清型有EV71、CVA3、CVA9、ECH030、EV68、CVB1;与支气管炎相关血清型ECH030、CVB2、CVB3。 结论1.2009年夏季儿童手足口病病原以CA16和EV71为主。EV71阳性率较之前报道有所上升,以C4亚型为主。对于手足口病,实时RT-PCR法较血清学检测特异性IgM抗体更适于疾病早期诊断。2.下呼吸道感染患儿血清EV-IgM抗体全年均可检测到,近年与下呼吸道感染相关的EV有柯萨奇病毒、EV68、EV71和ECH030等血清型。对于下呼吸道感染的EV诊断应综合考虑。
【学位授予单位】:中国协和医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:R725.1;R725.6
【图文】:

协和医学院,同等学力,学位论文,特异性引物


」匕京协和医学院同等学力申清硕_1学位论文结果分析16阳性样本VPI区扩增用两对CA16VPI区特异性引物(CA16一IF/CA16一ZR)及(CA16本进行PCR扩增。PCR产物大小分别约为297bp和881bp(凝胶电泳鉴定后送测序。10叶P2345678

序列,同源性,标本,序列同源性分析


图3PCR扩增CA16VPI部分基因片段(81一5:881bp片段扩增产物16vPI区核营酸序列同源性分析引物均扩增出10例标本。其中将SSlbp扩增片段8.70/0~98.5%。将标本与从Genbank中选取的不同年份VPI区基因序列进行同源性对比,与A基因组的国徽阜阳株(EU812514)的同源性均较低,分别为其他13株参比序列(属B基因组)的核普酸同源

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北京协和医学院同等学力申清硕1学位论文阳性样本VPI区扩增两对EV71VPI区特异性引物(EV71一3F/EV71一4R)及进行PCR扩增。PCR产物大小分别约为993bp(全脂糖凝胶电泳检测后送测序。

【引证文献】

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本文编号:2803087

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