空气污染与哮喘相关基因多态性对儿童哮喘影响的研究

发布时间：2020-09-10 07:42

　　研究目的：研究TRPV1、SOCS3和STAT6基因的单核苷酸多态性(SNP)与北京汉族儿童哮喘遗传易感性的关系；评估遗传因素、过敏原、空气污染及其他环境因素对北京汉族儿童哮喘影响的贡献率。研究方法：本研究采用成组的病例对照调查(221名病例,205名对照),病例为北京儿童医院及首都儿科研究所确诊的新发哮喘患者,对照为同一医院非哮喘、且无呼吸系统炎症患者。SNP的检测采用PCR纯化产物直接测序法,SNP特征通过卡方检验和Logistic回归分析SNP的等位基因频率(MAF)、基因型(genotype)及单倍型。室外空气污染物的浓度计算通过大气污染指数(API)值进行转换为浓度值,取5日连续平均浓度并进行对数转换；通过非条件Logistic逐步回归(向后法,α=0.10)检验遗传因素、过敏因素、空气污染及其他环境因素对北京汉族儿童哮喘影响的贡献率。研究结果： 1)经序列比对,北京汉族儿童TRPV1基因3'-非翻译区(UTR)的SNP包括4个SNP:rs4790522、rs4790521、rs402369及ENSSNP11193515.哮喘儿童和对照儿童rs4790521的等位基因频率存在显著差异(p0.05)；经模型拟合,rs4790521和rs4790522的基因型与儿童哮喘及特应性阳性相关(p0.05),rs4790521和rs4790522两SNP之间存在连锁不平衡；此2位点SNP构建的3个单倍型与儿童哮喘的易感性无显著相关性。调整混杂因素后rs4790521基因多态性、单倍型CC、5日平均空气污染物SO2浓度、家族遗传史、个体特应性状态(atopic status)及家族成员吸烟均为影响儿童哮喘的重要因素(p0.05)。 2)经序列比对,北京汉族儿童SOCS3基因的3'-UTR的SNP包括3个SNP：rs2280148、rs4969169及rs4969168,经检验哮喘儿童与对照儿童rs4969168的MAF差异经x2检验有显著统计学意义(P0.05)。经模型拟合及分层卡方检验(Cochran-Mantel-Haenszel)哮喘儿童与对照儿童rs4969168、rs4969169的基因型分布存在一定的差异(p0.05); rs4969169基因型与特应性阳性相关；rs4969168与特应性阳性无显著相关性,rs4969169和rs4969168与血清总IgE水平无显著相关性(p0.05)。调整混杂因素后,rs4969169、空气污染物SO2、家族遗传史及特应性状态均为影响儿童哮喘的重要因素(p0.05)。 3) TRPV1基因3'-UTR和SOCS3基因3'-UTR基因SNP关联分析显示SNP之间存在较强的连锁不平衡,哮喘儿童与对照儿童单倍型Hap-C/C的分布差异存在统计学显著性(p0.05)。 4)经序列比对,北京汉族儿童STAT6基因5'-UTR仅见1个SNP:rs71802646.北京汉族儿童rs71802646二核苷酸(GT)重复序列多态性包括3种：13GT(A1)、14GT(A2)和15GT(A3)。经分层卡方x2检验,哮喘儿童与对照儿童rs71802646的GT重复片段多态性差异无显著统计学意义(P0.05)；rs71802646的GT重复片段多态性与特应性阳性(atopy)及血清总IgE水平无显著的相关性(P0.05)。 5)经序列比对,北京汉族儿童STAT6基因3'-UTR未见已知的SNP位点,经BLAST (BASIC LOCAL ALIGNMENT SEARCH TOOL)比对发现在STAT6 3'-UTR区域的185319345位点(C258T)及185319352位点(T710C)为2个新的SNP(已注册)。经卡方检验哮喘儿童与对照儿童C258T及T710C等位基因频率(MAF)差异无显著统计学意义(P0.05)；经基因型拟合,哮喘儿童、特应性阳性(atopy)儿童与对照儿童C258T及T710C基因型分布差异无统计学显著性(p0.05);T710C基因型与血清总IgE水平相关(P0.05)；调整混杂因素后,T710C基因型对儿童哮喘影响的贡献不具有统计学显著性(p0.05)。 6)经非条件Logistic逐步回归(向后法,α=0.05)检验,TRPV1及GATA3基因的SNP、家族遗传史、个体特应性状态(atopic)、呼吸道感染和室内空气污染物TVOC浓度为影响儿童哮喘的重要危险因素。结论：TRPV1及SOCS3可能是与儿童哮喘相关的新的哮喘候选基因；STAT6非翻译区基因多态性与北京汉族儿童哮喘的关联不具有统计学显著性；影响汉族儿童哮喘的主要危险因素为遗传因素(贡献率为40%)和过敏因素(贡献率为38%)；在一定的遗传背景下,空气污染的短期波动可能对哮喘有一定的触发作用。
【学位单位】：中国疾病预防控制中心
【学位级别】：博士
【学位年份】：2010
【中图分类】：R725.6

【引证文献】